Тем не менее, 23 июля в Петропавловском соборе Минска состоялось церковное собрание, принявшее акт о церковной автономии: «...Православный клир и миряне бывшей Минской епархии..., сохраняя каноническую связь с законным священноначалием Православной Церкви Российской..., постановили объявить Православную Церковь, находящуюся в пределах независимой Республики Белоруссии, самоуправляющейся в делах местного значения». Собрание просило Мелхиседека встать во главе провозглашённой автономии и принять титул митрополита Белорусского и Минского. Мелхиседек согласился на это, сделав заявление: «Исходя из осуществлённой ныне идеи автономии, положенной в основу нового строя управления Белорусской Церкви, и пребывая в единомыслии с такими авторитетными иерархами, как митрополит Владимирский Сергий (Страгородский) и другие, заявившие особым актом о своём признании каноничности ВЦУ и законности его распоряжений, Церковное Управление Белоруссии считает пребывающее в Москве ВЦУ законным органом управления Российской Церкви с полномочиями до созыва поместного Всероссийского Собора, который установит форму управления Всероссийской Церкви и её автономных частей». Это заявление означало, что формально Мелхиседек, как и митрополит Сергий (Страгородский; впоследствии Патриарх Московский и всея Руси), признавая ВЦУ, временно уклонялся в обновленческий раскол, однако фактически оставался вне обновленчества. При номинальном признании ВЦУ в Минской епархии на деле наблюдалось противостояние распространению обновленческого раскола. ВЦУ отказалось утвердить провозглашение церковной автономии Белорусской церкви и не признало организованное в июле 1922 г. Церковное управление Белоруссии (ЦУБ). Однако Мелхиседек использовал противоречия между обновленческими группировками в целях сохранения и укрепления своего положения в епархии. После того как 2 ноября 1922 г. президиум ВЦУ принял решение об увольнении Мелхиседека на покой, утверждённое председателем ВЦУ епископом Антонином (Грановским) и его заместителем протоиереем Владимиром Дмитриевичем Красницким, Минский архиерей через другого обновленческого лидера протоиерея Александра Ивановича Введенского добился 10 ноября отмены этого решения. ВЦУ признало за Мелхиседеком титул митрополита. ЦУБ было реорганизовано в Белорусское епархиальное управление (БЕУ) с участием уполномоченного ВЦУ и представителей местных обновленческих групп, однако большинство в нём принадлежало сторонникам Мелхиседека. В начале 1923 г. ВЦУ согласилось на учреждение в обновленческой Белорусской митрополии трёх викарных кафедр. В марте того же года Мелхиседек возглавил в Минске вместе с признававшими в тот момент ВЦУ архиереями канонического поставления викарными епископами Смоленской епархии Вяземским Венедиктом (Алентовым; впоследствии архиепископ) и Гжатским Феофаном (Берёзкиным), хиротонии целибатного священника Феодосия Раменского (впоследствии в монашестве Филарет) и вдовых протоиереев Иоанна Пашина и Николая Шеметилло во епископов Борисовского, Мозырского и Слуцкого. Хиротонии совершались без пострижения посвящаемых в рясофор, «обновленческим чином», однако в том же году все епископы приняли монашество, и их хиротонии были признаны патриархом Тихоном (Беллавиным) каноничными.