Воспоминания об Игнатии Лойоле оставили его ученики и сподвижники; самое раннее – обширное послание Гомеса де Леона Диего Лайнеса Хуану Альфонсо де Поланко, секретарю Игнатия Лойолы, отправленное из Тренто 16 июня 1547 г. Письмо Гомеса де Леона Диего Лайнеса было широко известно среди иезуитов и впоследствии использовалось в процессе канонизации Игнатия Лойолы. В 1573–1574 гг. Гонсалвиш да Камара составил «Мемориал», в котором описал своё знакомство и совместную работу с Игнатием Лойолой, привёл многие его высказывания. Николас де Бобадилья (около 1509 – 1590 гг.), один из учеников Игнатия Лойолы, незадолго до смерти составил автобиографию, в которой привёл сведения, отсутствующие в других источниках. Уже в 1546 г. Педро ди Рибаденейра начал собирать материалы для биографии Игнатия Лойолы, при составлении которой использовал воспоминания сподвижников Игнатия Лойолы и материалы его архива. Латинская версия этой биографии, опубликованная в 1572 г., была объявлена официальным жизнеописанием основателя Общества Иисуса (в связи с этим изымались из обращения другие подобные сочинения, распространённые среди иезуитов); в 1583 г. была издана испанская версия. Материалы, посвящённые ранней истории Общества Иисуса и биографии Игнатия Лойолы, собирал также Хуан Альфонсо де Поланко; после ухода с должности секретаря в 1574 г. он составил «Хронику Общества Иисуса», которая долгое время оставалась неопубликованной (первое издание 1894–1898 гг.). Важные сведения об Игнатии Лойоле содержатся в сочинении по истории Общества Иисуса, составленном сподвижником Игнатия Лойолы, португальским иезуитом Симаном Родригишем (1510–1579 гг.), а также в ранних сочинениях иезуитов, например, в «Апологии Упражнений» и «Диалогах» Надаля. В 1585 г. с разрешения генерального настоятеля Клаудио Аквавивы была опубликована новая официальная биография Игнатия Лойолы, написанная итальянским иезуитом Джованни Пьетро Маффеи (1533–1603 гг.). В XVII–XVIII вв. на основе этих сочинений были созданы Жития Игнатия Лойолы. Круг источников заметно расширился, когда исследователям стали доступны материалы Римского архива Общества Иисуса, связанные с деятельностью Игнатия Лойолы, а также дневники его современников и документы канонизационного процесса, в том числе воспоминания очевидцев. Для изучения римского периода жизни Игнатия Лойолы особую важность представляют его многочисленные письма.