Существовали иконы с изображением Иоанна в монашеском одеянии, с непокрытой головой, иногда со свитком в руке – в центре иконы избранных святых, между преподобными Моисеем Муриным и Моисеем Угриным, с образами Божьей Матери «Казанская» и «Взыскание погибших» (вторая половины XIX в., частное собрание), на поле гуслицкой двухрядной иконы с образом Божьей Матери «Всех скорбящих Радость» и с избранными святыми (1892 г.), на поле сызранской иконы с Распятием Христовым и четырьмя образами Божьей Матери (конец XIX в., частное собрание). На калужской иконе Божьей Матери «Всех скорбящих Радость, с избранными святыми» последней четверти XVIII в. (частное собрание) Иоанн написан по пояс в земле под фигурой Пресвятой Богородицы на облаке; на ветковской иконе подобной иконографии – в левой части среди предстоящих святых, в мантии и клобуке (середина XIX в.); на иконе избранных преподобных 1892 г. письма Т. Юркина (частное собрание) Иоанн – юноша с непокрытой головой во втором ряду справа. Кроме того, образ Иоанна был широко распространён в памятниках декоративно-прикладного искусства. Так, в коллекции Киево-Печерского музея-заповедника хранится образец церковного шитья конца XVII – начала XVIII вв. – бархатная шапочка, по форме подобная скуфье, вероятно, одна из так называемых шапочек Иоанна, которые освящались на его мощах, затем их дарили гостям и жертвователям обители. Гравюра из патерика легла в основу композиции на одной из частей шапочки: внизу полуфигура Иоанна  крестообразно сложенными руками, в снопе лучей, восходящих к образу Иисуса Христа в облаках, ангел возносит душу преподобного, справа на облаке вышит ангел с венцом и цветущей ветвью в руках. Подобный образ Иоанна с двумя ангелами выполнен чернью на обороте панагии второй половины XVIII в. (на лицевой стороне – изображение преподобных Антония и Феодосия на эмали), вложенной в Киево-Печерскую лавру настоятелем Богоявленского монастыря в Костроме (Исторический музей). В середине – второй половине XIX в. получили распространение изготовленные в Ростове эмалевые иконки с полуфигурой Иоанна в пещере, с книгой, с черепом, с лампадой или со свечой (Исторический музей, музей Андрея Рублёва). В киевской деревянной резьбе поясной образ Иоанна (в пещере, со скрещенными руками, с черепом и книгой) включался в ряд сюжетов паломнических икон; в частности, он присутствует в нижней части композиции под престолом на Печерской иконе Божьей Матери второй половины XVIII в. (музей Андрея Рублёва), первой трети XIX в. (Егорьевский историко-художественный музей), первой половины XIX в. (Исторический музей), второй половины XIX в. (музей Андрея Рублёва), а также на иконах XIX в. с фигурами преподобных Антония и Феодосия Киево-Печерских по сторонам Успенского собора лавры (иногда с избранными святыми).