Начиная с 1943 г., после того как было принято принципиальное решение использовать Codex A в качестве основы издания, велась подготовительная работа к публикации первых томов собрания сочинений. 8 сентября 1950 г. в Антониануме были представлены два начальных тома критического издания, содержавшие Пролог и начало первой книги «Ordinatio». Поскольку тома издания публикуются в типографии Ватикана, это собрание сочинений получило неофициальное название «Editio Vaticana» («Ватиканское издание»). В 1960 г. в рамках собрания сочинений было начато издание ранних оксфордских «Вопросов» Иоанна Дунса Скота по «Сентенциям» – «Lectura». Поскольку тома 1–15 были зарезервированы для «Ordinatio», первый том «Lectura» вышел как 16-й том собрания сочинений. К 2009 г. издано 17 томов: тома 1–11 содержат Пролог, книги 1–3 и разделы 1–7 книги 4 «Ordinatio»; тома 16–21 содержат книги 1–3 «Leсtura». Работа над изданием собрания сочинений продолжается. Ввиду медленного продвижения ватиканского издания руководством францисканского ордена было принято решение осуществить независимо от него издание всех философских сочинений Иоанна Дунса Скота. За выполнение этой задачи взялись католические учёные из Францисканского института при Университете св. Бонавентуры в США. К настоящему времени этот издательский проект завершён, выпущено пять томов. В том же Францисканском институте в 2005–2008 гг. было осуществлено издание первой книги «Reportatio Examinata» в двух томах. Помимо фундаментальных многотомных изданий в XX в. выходили научные издания отдельных трудов Иоанна Дунса Скота: «Трактата о Первоначале», «Вопросов на произвольные темы» и других сочинений. Однако, несмотря на значительные успехи в деле издания полного корпуса сочинений Иоанна Дунса Скота, эта задача ещё далека от завершения, поэтому исследователям философии и теологии Иоанна Дунса Скота нередко приходится обращаться к старым изданиям, а в некоторых случаях – к рукописям. Все сочинения Иоанна Дунса Скота (за исключением двух небольших трактатов: «De primo principio» и «Theoremata») с точки зрения жанра имеют получившую к концу XIII в. весьма широкое распространение форму «вопросов». Этот жанр тесно связан с особенностями университетского образования того времени и отражает схему преподавания в университетах и структуру учебных диспутов. Если учитель хотел представить собственное мнение относительно некой спорной и допускающей различные решения проблемы, он организовывал обсуждение (диспут, disputatio), в процессе которого интересующая его проблема формулировалась в виде вопроса (quaestio). Такие «вопросы» в XIII в. получили особое наименование: «вопросы для обсуждения» или «спорные вопросы» (quaestiones disputatae). В этот период «вопросы» уже не обязательно отражали реальные университетские дискуссии, но повторяли их структуру. В наиболее общем виде «вопрос» строится следующим образом: вначале формулируется некая проблема, имеющая, по крайней мере, два (чаще – больше) различных варианта решения. Далее предлагается решение проблемы, либо принимаемое автором, либо (гораздо чаще) противоположное принимаемому им.