В источниках существуют расхождения по поводу датировки этих событий. Василиане считали, что разорение монастыря произошло в 1630 г., при этом в помяннике Каневского василианского монастыря (1780–1814 гг.) как дата гибели Макария обозначен 1678 г. Жители Переяславля считали, что Макарий был каневским игуменом в гетманство Богдана Михайловича Хмельницкого и замучен в Каневе в сентябре 1653 г. Эти же сведения приведены в «Ведомости о епархии Переяславской» (Российский государственный исторический архив). Однако свидетельств о разорении Канева татарами в 1653 г. нет. На «Служебнике» из каневской Георгиевской обители была запись: «Я, еросхимонах Иларион, надаю Служебник сей до обители Успения Пресвятой Богородицы монастира Каневского, року [1658], м-ця априля, 29 дня». Следовательно, Каневская обитель не была разорена к 1658 г. В 1688 г. были обретены мощи Макария. Поскольку сохранялась опасность захвата обители униатами, 16 (17) марта 1688 г. их перенесли в Воскресенскую церковь в Переяславле (в 40 верстах от Канева). Епископ Захария (Корнилович) получил разрешение у царя Петра I, посетившего Киев после Полтавской битвы, построить на месте разрушенного кафедрального собора в Переяславской крепости церковь во имя архангела Михаила и монастырь. По царскому указу губернатор Киева князь Дмитрий Михайлович Голицын в 1711 г. велел отвести место для построения келий и монастыря «и на оном построивши монастир коштом своим» (Российский государственный исторический архив). 8 ноября 1713 г. состоялось перенесение мощей Макария в новопостроенный Михайловский храм, которое возглавил епископ Захария (Корнилович). 14 августа 1734 г. в монастыре был сильный пожар, Михайловский храм сгорел, мощи Макария переместили в монастырскую трапезную. 26 октября 1734 г. мощи были перенесены в построенную часовню. В 1737 г. в монастыре были сооружены новая трапезная церковь в честь Благовещения Пресвятой Богородицы, ограда, кельи и колокольня. Мощи святого передали в церкви Благовещения, где они «явленно в раке опочивали». 13 мая 1750 г. мощи святого были перенесены епископом Никодимом (Сребницким) в отремонтированный Михайловский храм. В память об этом событии в Переяславле ежегодно 13 мая перед литургией совершался крестный ход вокруг храма с мощами святого. Именно в это время в город ежегодно прибывало наибольшее число паломников. В связи с закрытием Михайловского монастыря мощи святого 4 августа 1786 г. перенесли в переяславский Вознесенский монастырь, где они находились в посвящённом преподобномученику приделе, в кипарисовой раке, оправленной в серебро и вызолоченной в 1791 г. на средства Белгородского епископа Аггея (Колосовского), жившего в монастыре на покое. В 1942 г. их перенесли в Троицкую церковь в городе Черкассы (ныне Украина), в 1965 г. – в храм Рождества Пресвятой Богородицы в том же городе. С 26 мая 2003 г. мощи Макария почивают в черкасском Свято-Михайловском кафедральном соборе. Исследователям известны прижизненные чудеса Макария: он исцелил ослепшего после болезни жителя Канева; вернул на праведный путь каневского судью-мздоимца, которому неоднократно посылал деньги с запиской: «Отдаю последнее, более не имею, пощади себя и меня». Своими наставлениями святой вернул матери нерадивого сына: с этим чудом связано «правило преподобномученика Макария» – практика постоянного чтения молитвы «Отче наш», благодаря которой юноша встал на путь исправления.