В эту сумму не входили доходы от продажи мест на монастырском кладбище, от переливки части серебряных окладов и продажи полученных слитков. Существенно подорвали благосостояние обители значительные траты на мощение улиц, окружавших монастырь по периметру; их площадь составила больше 400 кв. сажён. В результате монастырь не имел средств на ремонт и поддержание монастырских зданий. После 1764 г. штатное жалованье Московского в честь иконы «Знамение» мужского монастыря составило около 283 руб. Спустя сто лет эта сумма выросла до 860 руб. 44 коп. Монастырю были оставлены несколько лугов, мельница, пруд. В 1843 г. в пользование обители передали урочище Федорова Роща в Богородском уезде Московской губернии, где был основан монастырский хутор, а в 1912 г. выстроен двухэтажный корпус с домовой церковью во имя великомученика Пантелеимона, святителя Модеста и пророка Илии. По данным на 1866 г., от сдачи в аренду земель монастырь ежегодно получал 2442 руб. 14,5 коп. Существенный доход приносила сдача внаём помещений на территории монастыря, а также в Городской и Пятницкой частях Москвы. Для этой же цели со стороны Большого Знаменского пер. монастырь выстроил в 1825–1827 гг. два подворья. Если в 1770 г. он получал от сдачи в аренду своих зданий 221 руб., то к 1857 г. эта сумма выросла до 3110 руб. На ремонтно-строительные работы Московский в честь иконы «Знамение» мужской монастырь стал получать дополнительные суммы от государства, в том числе 1500 руб. в 1776–1778 и 12 тыс. руб. в 1782–1784 гг. Значительную сумму (20 тыс. руб.) монастырь получил от императора Александра II за передачу в Дворцовое ведомство палат бояр Романовых. Наконец, частные вкладчики поддерживали обитель, передавая ей билеты сохранной казны. К 1860 гг. эти билеты ежегодно приносили 500 руб. Во время революционных событий в Московском в честь иконы «Знамение» мужском монастыре настоятельствовал (1914–1920 гг.) архимандрит Аристарх (Николаевский). Затем настоятелем был архимандрит Митрофан (Гринёв; 30 августа 1920 г. – 1 ноября 1920 г.). 24 апреля 1922 г. в соответствии с декретом советской власти об изъятии церковных ценностей были конфискованы богослужебные сосуды, ризы, оклады. В 1923 г. монастырь был закрыт, а братские корпуса заняты жилыми товариществами. В настоятельском и братском корпусах разместилась также начальная школа. После закрытия обители в соборе продолжили служить некоторые из насельников монастыря, в том числе иеромонах Серафим (Иванов) до 1928 г., когда храм был закрыт, и его помещение переоборудовано под фабрику и жилые помещения: разобраны главы, боковые барабаны и крыльцо XVIII в. С запада к собору был пристроен двухэтажный жилой дом. Монастырские здания по Елецкому (Большому Знаменскому) и частично по Максимовскому (Малому Знаменскому) переулкам были снесены в 1940 гг. К сносу предназначались и остальные здания Московского в честь иконы «Знамение» мужского монастыря, оказавшиеся в аварийном состоянии.