К середине апреля 1829 г. был полностью укомплектован штат архиерейского дома (56 служителей). В начале 1830 г. архиерейский дом был устроен в постоянном здании, консистория переехала во флигель Межевой конторы. Моисей, по его словам, видел смысл своей архипастырской деятельности в служении ближним, помощи нуждающимся, опекал вдов, сирот и престарелых. Одним из первых учреждений, открытых при его содействии, стало епархиальное Попечительство о бедных духовного звания (1829 г.). Выделяемых церковными властями средств (1910 руб. в год) было недостаточно, и Моисей призвал жителей и духовенство епархии начать сбор пожертвований в пользу бедных; эти деньги стали одним из главных источников попечительских средств. Также по личному ходатайству Моисея отдельным семьям неоднократно выделял средства Синод. Моисей провёл обстоятельную ревизию церковных земель, чтобы обеспечить все причты земельными участками, как это предписывал закон. В 1830–1831 гг. в 48 губерниях России (в том числе и в Саратовской) свирепствовала эпидемия холеры. Усилиями Моисея никто из умерших (смертность доходила до 100 и больше человек в сутки) не остался без церковного отпевания. Было устроено специальное кладбище вне города, в помощь отпевавшим священникам Ильинской церкви были выделены два иеромонаха и три священника. Также было распространено обращение Моисея к пастве «О беспрекословном исполнении повелений гражданского начальства, относящихся к пресечению болезни холеры» (Государственный архив Саратовской области). Доступное по форме, глубокое по содержанию и сильное по эмоциональному воздействию, воззвание дало результаты, которых не могли добиться гражданские власти, пытавшиеся убедить людей уничтожать все вещи умерших и болеющих. После окончании эпидемии Моисей сразу предпринял поездку по епархии (осень 1831 г.) с целью оказать моральную поддержку духовенству и пастве. Хлопотами Моисея была открыта Саратовская духовная семинария, в которой получили возможность учиться жители Саратовской губернии, до этого получавшие духовное образование в Пензенской, Тамбовской, Астраханской, Казанской, Воронежской и других духовных семинариях, а также выпускники тёх действовавших в епархии духовных училищ. Наличие своей духовной семинарии позволяло епархии исправить ситуацию с уровнем образования среди священнослужителей, поскольку, согласно указу Синода от 9 декабря 1829 г., замещать священнические вакансии следовало кандидатами, окончившими полный семинарский курс, в то время как в Саратовской и Царицынской епархии (согласно клировым ведомостям за 1829 г.) из 730 священнослужителей лишь 140 имели полное семинарское образование, 243 не окончили курса духовной семинарии, 347 не поступали в духовную семинарию. Моисей пытался открыть семинарию ещё в 1829 г., однако не успел решить вопрос, связанный с её размещением. Позже для духовной семинарии и общежития для студентов недалеко от саратовского Свято-Троицкого собора у помещика М.А. Устинова были куплены четыре здания с семью флигелями и подсобными помещениями. 5 августа 1830 г. доклад Комиссии духовных училищ об открытии Саратовской духовной семинарии утвердил император Николай I.