Перед отъездом, 4 декабря посетил церковно-учительскую школу. 24 декабря Модест прибыл в Житомир. Первые распоряжения на Волыни касались церковно-школьного дела. 1 октября 1890 г. по предложению Модеста при лавре была открыта Почаево-Лаврская епархиальная церковно-учительская школа, смотрителем её назначен наместник архимандрит Модест. На Волыни Модест возбудил ходатайство перед гражданской властью о внимательном отношении мировых посредников к церковно-школьному делу. «Оставление детей вне правильного обучения в школах есть одно из важных препятствий к разумному познанию и усвоению ими предметов святой веры и всего, что полезно для благополучной частной и общественной жизни людей». Также Модест уделял внимание учреждению библиотек и читален для народа. Регулярно Модест совершал ревизионные поездки по епархии, отчёты печатались в «Волынских епархиальных ведомостях». Предписал духовенству выработать программы чтения проповедей, вести дневник внебогослужебных чтений; заботился о поставлении в сельских приходах грамотных диаконов, об организации приходских хоров и развитии церковного пения, введении общего пения при богослужении. 24 февраля 1890 г. дал предписание консистории доставлять сведения о наличии братств, их правилах, ведении в приходах летописей. В марте 1890 г. впервые посетил Почаевскую лавру. Предложил Собору лавры увеличить хор и пригласить регента для обучения послушников обиходному пению. Осенью того же года в Москву были направлены помощник типографа лавры иеродиакон Никон и заведующий монастырской книжной лавкой иеродиакон Феодот для знакомства с ведением дела в синодальной типографии. При Модесте в лавре были построены новые здания типографии, которая значительно расширила свою деятельность, школы и иконописной мастерской. В 1890 г. Модест заказал в афонском Пантелеимоновом монастыре копию иконы Божьей Матери «Геронтисса». 30 мая 1891 г. в праздник Вознесения Господня этот образ был доставлен в лавру. В одной из комнат архиерейского дома Модест устроил церковь во имя архангела Михаила. В 1894 г. открыл киновию на лаврской пасеке для проживания престарелых и немощных насельников. Благодаря Модесту лавра получила от казны значительный надел леса. Заботился об увеличении в обители числа учёных монахов. Для поднятия образовательного ценза монашества в марте 1890 г. Модест предложил при каждом монастыре устроить школу, в которой после богослужения под руководством опытного насельника все монашествующие и послушники изучали бы догматическое и нравственное богословие, библейскую и церковную историю, историю богослужения, литургику и другие предметы.