С осени 1918 г. по июль 1922 г. Лев читал там лекции по русской литературе. 28 марта 1922 г. по его предложению совет общебратского союза решил, что необходимы элементарные общедоступные курсы, дающие возможность каждому православному защищать свою веру, для чего следует организовать центральное содружество для более серьёзного изучения вопроса. Однако летом 1922 г. на многих руководителей и активистов петроградских братств, прежде всего, Александро-Невского, обрушились репрессии. Утром 1 июня был арестован митрополит Вениамин (Казанский), а через несколько часов агенты ГПУ задержали насельников лавры; их стали подвергать допросам, стремились сфабриковать отдельное дело православных братств. 3 июня в 4 часа утра в лавру вновь явились агенты ГПУ и предъявили ордер на обыск и арест Льва, но найти его не смогли. 16 июня он всё же был арестован. Проведённые допросы и обыски более сорока арестованных по делу православных братств мало что дали следственным органам. Льва допрашивали дважды – 27 июня и 17 августа. Как и большинство других обвиняемых, он не видел ничего предосудительного и запретного в протекавшей совершенно открыто деятельности братств и отверг какие-либо обвинения в контрреволюции. Доказать противодействие членов братств изъятию из храмов ценностей не удалось. 21 августа были освобождены под подписку о невыезде почти все обвиняемые, кроме семи человек, в том числе – Льва. 14 сентября 1922 г. Петроградское отделение ГПУ на закрытом заседании постановило выслать их из Петроградской губернии на два года как политически неблагонадёжных. Лев отбывал ссылку сначала в Оренбургской губернии, а затем близ озера Эльтон (современная Волгоградская область). Во время его отсутствия в Петрограде, несмотря на репрессии, деятельность Александро-Невского братства не прекращалась, а в 1925 г. вновь начала оживляться. Один за другим из ссылки возвратились основатели братства. В ряду первых ещё в конце 1924 г. был освобождён и вернулся в Ленинград Лев. Однако ему не удалось устроиться в штат какого-либо храма, и до осени 1926 г. он служил периодически, в качестве приписного священника для совершения ранних обеден. Зарабатывал переплётным делом. В 1930 гг. в его лагерной карточке в качестве светских специальностей были указаны: педагог, переплётчик (стаж два года) и счетовод (стаж четыре года). На 1926–1928 гг. пришёлся относительно благоприятный период подвижнического служения Льва и существования Александро-Невского братства, деятельность которого оставалась нелегальной, но прямо не преследовалась. В это время братство возглавляли иеромонахи Лев (Егоров), Гурий (Егоров) и Варлаам (Сацердотский). В октябре 1926 г. Льва назначили настоятелем одного из крупнейших соборов города – храма Феодоровской иконы Божьей Матери на пересечении Полтавской и Миргородской улиц. Постепенно туда перешла большая часть членов братства и в 1930 г. два братских хора. Лев был возведён в сан архимандрита и с марта 1926 г. стал исполнять обязанности благочинного монастырских подворий, преподавателя русской литературы и члена педагогического совета Богословско-пастырского училища. Осенью 1925 г. некоторые церковные круги выдвигали его в качестве кандидата в епископы. В декабре 1925 г. – июне 1926 г. временно управляющий Ленинградской епархией настоятель лавры епископ Григорий (Лебедев) рассматривал архимандритов Льва и Гурия в качестве своих ближайших помощников. Весной 1927 г. Лев был арестован во второй раз. В это время в Богословско-пастырском училище обучалось около 70 человек, и, вероятно, его растущая популярность стала причиной создания ГПУ «дела Богословско-пастырского училища».