Также в Греческой коллегии обучались итальянцы, итало-албанцы, итальянские и мальтийские греки. В среднем в коллегии одновременно учились около сорока юношей, поступавших в возрасте от 10 до 14 лет. Среди выпускников Греческой коллегии эллинист, эрудит, теолог, хранитель Ватиканской библиотеки Лев Алляций (1586 или 1588 – 1669 гг.); поборник униатского движения в Западнорусских землях Пётр Аркудий (около 1563 – 1633 гг.); поэт, переводчик с греческого языка епископ Франческо Аркудио (1590–1641 гг.); антиквар, хранитель Ватиканской библиотеки Никколо Аламанни (1583–1626 гг.); кипрский богослов Неофит Родинос (1576/1577 – 1659/1669 гг.); преподаватели Падуанского университета Иоанн Коттуниос (1572–1657 гг.) и Иоанн Кигалас (1622–1687 гг.), униатские Киевские митрополиты Иосиф Вельямин Рутский (1574–1637 гг.) и Рафаил Корсак (ум. в 1640 г.); миссионер в Польше митрополит Джакомо (Иеремия) Барбариго (1580–1637 гг.); архиепископ Иоанн Кариофилл (около 1565 – 1635 гг.); архиепископ Феофан (Прокопович; 1681–1736 гг.) и др. В 1693 г. Греческая коллегия оказалась под угрозой закрытия, т.к. количество студентов сократилось до 18; было решено пополнить коллегию студентами-католиками латинского обряда с греческих островов, что привело к переориентированию коллегии на подготовку латинских миссионеров на Леванте. В 1763 г. в коллегии обучалось только семь греческих студентов с Востока. В 1803 г. Греческая коллегия (как и другие папские коллегии в Риме) была закрыта. Её деятельность возобновилась в 1845 г. по указанию папы Григория XVI; тогда были приняты 15 студентов (восемь студентов из Русинской греко-католической церкви, четыре студента из Мелькитской католической церкви, три студента из Итало-Албанской католической церкви). В 1849 г. папа Пий IX учредил четыре стипендии для студентов-румын. В 1886 г. папа Лев XIII поручил руководство коллегией конгрегации воскресенцев, а в 1890 г. вновь передал коллегию под управление иезуитов. С открытием в 1897 г. Украинской коллегии святого Иосафата Кунцевича Греческую коллегию покинули студенты-рутены. В том же году папа Лев XIII motu proprio «Sodalium Benedictinorum» передал руководство Греческой коллегией Ордену бенедиктинцев, обязав их сохранять восточные традиции и разрешив некоторым бенедиктинцам перейти из латинского в византийский обряд. Коллегию возглавил выходец из Бельгии аббат-примас Ильдебранд де Эмптин, который восстановил в Греческой коллегии изучение греческой словесности, восточного канонического права, восточной литургики, тогда как философско-богословскую подготовку воспитанники получали в коллегии Конгрегации пропаганды веры. С 1919 г. руководство коллегией было возложено на бельгийских бенедиктинцев, а с 1956 г. – на бенедиктинское аббатство Шевтонь. В настоящее время в Греческую коллегию принимают студентов из Восточных католических церквей, а также поместных православных церквей (главным образом, из Константинопольской православной церкви и Элладской православной церкви). В процессе обучения основное внимание уделяется духовным и культурным традициям восточного христианства. Коллегия располагает ценным архивом и богатой библиотекой, в которой хранятся манускрипты, инкунабулы и печатные издания XVI в.