Малиевецкий (Малиевский) в честь Рождества св. Иоанна Крестителя (мужской, существовал в современном селе Малиевцы Дунаевецкого района, основан в 1708 г. униатами на месте православной обители, упразднён в 1795 г.), Ломачинецкий Покровский (мужской, в современном селе Ломачинцы Виньковецкого района, существовал в 1920 гг.), Скаржинецкий Николаевский (мужской, действовал в селе Скаржинцы Яромолинецкого района, основан в 1909 г. как скит, с 1920 г. – самостоятельный, упразднён в конце 1920 гг.). Ранее входившие в Подольскую епархию: Преображения Господня (женский, в селе Головчинцы Хмельницкой области, упоминается с 1540 г. как мужской, стал униатским, с 1795 г. – православный, в 1888 преобразован в женский, упразднён в 1920 гг., действовал в 1942–1962 гг., возрождён в 1996 г.), Снитовский (мужской, в местечке Снитовка Летичевского уезда, ныне Хмельницкой области, упоминается в 1553–1654 гг.), Семенецкий Петропавловский (мужской, в селе Семенки современной Винницкой области, основан в 1595 г. как православный, закрыт в XVII в., возобновлён в 1715 г. как униатский, с 1837 г. – православный, в 1838 г. переведён в Бар), староконстантиновский Крестовоздвиженский (женский, известен до 1596 г., в 1730 г. упоминается как униатский, упразднён до 1745 г.), бершадский Преображенский (мужской, существовал в городе Бершадь ныне Винницкой области, основан в 1616 г., упразднён в 1789 г., восстановлен в 1794 г., закрыт после 1921 г.), винницкий братский Вознесенский (мужской, в Виннице, упоминается в 1631–1638 гг.), винницкий Благовещенский (женский, в Виннице, основан в 1635 г., в начале XVIII в. захвачен униатами, с 1795 г. – православный, в 1845 г. переведён в Браилов), Грановский Преображенский (мужской, существовал близ местечка Гранов Гайсинского уезда, основан до 1650 г., в 1744 г. стал униатским, с 1795 г. – православный, упразднён в 1920 гг.), Клещовский Николаевский (мужской, существовал в современном селе Клещов Тывровского района Винницкой области, упразднён в 1654 г., в 1730 г. на его месте действовал униатский монастырь), Голодьковский Николаевский (мужской, в селе Голодьки Литинского уезда, ныне Винницкой области, известен с 1700 г. как православный, действовал в 1731–1740 гг. как униатский, закрыт до 1745 г.), Микулинско-Рожецкий Крестовоздвиженский (женский, в селе Микулинцы Литинского уезда, ныне Винницкой области, основан как православный раньше 1716 г., около 1733 г. стал униатским и перенесён в селе Рожок, лишён самостоятельного статуса в 1745 г., с 1795 г. – православный, упразднён в 1798 г.), шаргородский во имя святителя Николая (мужской, в Шаргороде, основан как униатский Онуфриевский в 1718 г. в Калиновке близ Шаргорода, в 1747 г. переведён в Шаргород, с 1795 г. – православный, упразднён в 1920 гг., возрождён в 1996 г.), Немировско-Волчанский Троицкий (мужской, существовал в селе Волчок современной Винницкой области, упоминается в 1724 г. как бывший православный, в 1744 г. закрыт униатами),