При монастырях были основаны духовные школы, в Курмухской епархии их насчитывалось семь. Преподавали Закон Божий, философию, историю Грузии (по своду летописей «Картлис Цховреба») и историю Кавказской Албании. В 1310 г. Курмухскую епархию посетил католикос-патриарх всей Грузии Евфимий III. По его указанию курмухели архиепископ Кирилл (Донаури) приказал священнику церкви великомученицы Варвары в Кахи Иессею (Ясе; Китиашвили) и его 12 ученикам переписать Четвероевангелие и передать рукописи в церкви, монастыри и школы епархии. Священнослужители Курмухской епархии занимались миссионерской деятельностью на Северном Кавказе, проповедь не прекращалась и во время монгольского нашествия. Анонимный историк XIV в. при изложении событий конца XIII в. повествует о том, как «в те же времена блистал Пимен блаженный, что удалился из (пустыни Гареджи) и поселился в одном из гротов в Белакани; обратил из язычества (в христианство) племена леков (лезгин), которые и пребывают в вере Христовой. Вместе с ним блистал также великий оный подвижник Антон Наохребелис-дзе, родом месх». В агапах (поминальных записях) XIV–XV вв. Крестового монастыря в Иерусалиме упоминается Липарит Гишели, однако исследователям неясно, был он архиереем Гишским или владетелем региона Гиши. К 1370 гг. Грузия потеряла Шеки. С XVI в. в связи с увеличившимися вторжениями персидских войск и массовым переселением лезгин значительно отодвинулись восточные границы грузинского царства Кахети: во второй половине XVI в. были потеряны Цукети и Гиши, в начале XVII в. – земли между реками Гишисцкали и Курмухисцкали (современный Курмухчай), в начале XVIII в. – земли до реки Мачисцкали (современный Мацимисцкали). Территориальные потери сопровождались исламизацией коренного населения. В Восточной Кахети на территории бывшей провинции Эрети образовались султанство Элису и вольные общины Джаро-Белоканы. За грузинским населением закрепилось название «ингило», регион стал называться Саингило. Демографические и политические изменения повлекли перемены в церковной географии: Гишская (Курмухская) кафедра была упразднена во второй половине XVI в., паства вошла в юрисдикцию «митрополита Кахети», т.е. Алавердского архиерея. После присоединения Восточной Грузии к Российской империи (1801 г.) началось покорение Джаро-Белокан и Элису (до 1830 г.). В 1850 г. к наместнику на Кавказе князю Михаилу Семёновичу Воронцову из Саингило (Закатальского округа) прибыла делегация ингилойцев с просьбой окрестить их; наместник стал крестным отцом первых ингилойцев-христиан. Начался активный процесс обращения местного грузинского населения в христианство. Значительные христианские общины были в Кахи, Корагани, Алибегло, Котуклу, Мешабаши. В церковном отношении регион Саингило вошёл в юрисдикцию Алавердского викариатства Карталино-Кахетинской епархии Грузинского экзархата РПЦ. После восстановления автокефалии ГПЦ в 1917 г. территория Курмухской епархии была включена в состав Бодбийской епархии ГПЦ, в 1995 г. – Некресской. В 2009 г. эти районы были переданы в прямое подчинение католикосу-патриарху всей Грузии Илии II (Гудушаури-Шиолашвили) в составе Дедоплисцкаройской (Хорнабуджской) епархии ГПЦ. 3 июня 2014 г. грузинские приходы исторической провинции Эрети были выделены в самостоятельную Эретскую (Кахско-Курмухскую) епархию ГПЦ.