Значительные массы населения стали испытывать ностальгию по НДРЙ. После того как в 1990 г., во время кризиса в Персидском заливе, Йемен поддержал Саддама Хусейна, на Сану были наложены экономические санкции. Свыше 850 тыс. йеменских гастарбайтеров выслали из стран Персидского залива на родину. Это привело к тяжёлому экономическому кризису, массовой безработице, нехватке средств на социальные и экономические программы. После парламентских выборов весной 1993 г. значение ЙСП снизилось в политической системе Йемена. Помимо партии Салеха – Всеобщего национального конгресса (ВНК) – быстро набирало вес созданное в 1990 г. Йеменское единение за реформу (Йеменская партия Ислах) – партия умеренных исламистов и феодально-племенных лидеров просаудовской ориентации во главе с шейхом аль-Ахмаром, вождём конфедерации племен хашид. Партия Ислах вела борьбу с ЙСП под лозунгом отстаивания йеменской идентичности против «западного» секуляризма социалистов. Президент в борьбе за лидерство выбрал исламизм как главное орудие мобилизации общества против социалистов Юга. Аль-Бейд и его сторонники обвиняли Салеха в стремлении узурпировать власть и невыполнении взятых на себя обязательств. Летом 1993 г. аль-Бейд со своим окружением демонстративно переехал в Аден. Нарастающий конфликт усугубляло то, что Вооружённые Силы ЙАР и НДРЙ в отличие от других государственных институтов не были слиты. Воинские части остались «северными» или «южными» по составу, но были перераспределены по стране. В конце апреля 1994 г. начались широкомасштабные вооружённые столкновения армейских частей и племенных ополчений, ориентировавшихся на Салеха и аль-Бейда. При этом исламисты Юга поддерживали Север, а племена бакиль выступили на стороне Адена. Стороны обменивались ракетными ударами, бомбили и обстреливали города. 21 мая аль-Бейд объявил об отделении Юга и провозгласил Демократическую Республику Йемен. Саудовская Аравия, заинтересованная в развале единого государства, в ограниченных масштабах поддерживала южан. Тем не менее, 7 июля Аден был взят северянами, а аль-Бейд бежал из страны. В военных действиях погибло около 7 тыс. человек. Победители отвергли все прежние договорённости и построили свою версию йеменского единства, теперь уже под управлением Севера. ЙСП была исключена из правительства, власть разделили ВНК и партия Ислах. В течение десяти лет сохранялся стратегический союз этих двух сил, возглавлявшихся президентом Салехом и председателем парламента шейхом Абдаллахом аль-Ахмаром (ум. в 2007 г.). Экономическое положение страны оставалось крайне тяжёлым. Ущерб от войны составил 11 млрд. долларов. Расходы на силовые структуры достигали 40% бюджета. Численность населения, прираставшая на 2,7% в год, к концу 2000 гг. приблизилась к 23 млн. Население городов увеличивалось на 5% в год, что усугубило проблемы с водоснабжением, особенно в Сане. Сохранились противоречия Севера и Юга, как и разрыв в уровне жизни, который на Юге вдвое ниже, чем на Севере. ВВП на душу населения в 1994 г. составлял 335 долларов. 63% населения занято в сельском хозяйстве. В 2000 гг. экспорт нефти обеспечивал 25% ВНП, однако нефтяные ресурсы быстро иссякают. Промышленность остаётся в зачаточном состоянии. Слабая сеть путей сообщения, нехватка квалифицированных кадров во всех отраслях и недостаточная ёмкость потребительского рынка не способствуют развитию крупного промышленного производства.