Обители предписывалось подчиняться Киевскому митрополиту Иоасафу (Кроковскому). Вместе с грамотой царь издал указ «российскому послу, находящемуся в Польше, о чинении оному монастырю всякого в нуждах вспоможения». Очевидно, именно это событие отразилось в записанном в середине XIX в. народном предании о посещении Почаевского монастыря Петром Великим, богато одарившим настоятеля. В августе 1712 г. из-за усиления нападок со стороны униатов Иосиф с частью насельников и монастырских слуг покинул Почаев и перешёл в козелецкий Георгиевский монастырь. Почти сразу после отъезда Иосифа, 24 августа, настоятелем Почаевской обители был избран Пахомий (Вышгерд-Заблоцкий), под руководством которого в 1714 г. состоялся переход монастыря в унию. Живя в Георгиевском монастыре, Иосиф предполагал со временем вернуться в Почаев и заботился о расширении владений Почаевского монастыря. Приобретя в 1714 г. деревню Лихолетовку по соседству с Козелецким монастырём на деньги, привезённые из Почаева, Иосиф добился определения Глуховского генерального суда, в соответствии с которым Лихолетовку «не имеет права присвоить себе козелецкий монастырь». В 1717 г. почаевский постриженик Игнатий (Расновский) привёз в Москву Рязанскому митрополиту Стефану (Яворскому) письма от Иосифа, «коими игумен просил его о защищении благочестия и чтоб ему, игумену, с братством старанием Его Преосвященства паки возвратиться в Почаевский монастырь». Однако возвращение Иосифа (Саевича) в Почаев не состоялось. В 1719–1722 гг. он был настоятелем Святогорского в честь Успения Пресвятой Богородицы монастыря в Псковской епархии. В январе 1720 г. Иосиф ходатайствовал перед Синодом о возвращении обители нескольких оброчных угодий, озёр Воронич, Белогули и перевоза на реке Сороть, которыми завладели староста Георгиевской церкви (Георгиевской волости) и жители местности Воронич, а также о запрещении «кабатчикам с Воронича приезжать с кабаком» к Святогорской обители. В сентябре-ноябре 1721 г. Иосиф находился в Санкт-Петербурге в связи с предполагавшимся его назначением на служение при мекленбургской герцогине Екатерине Ивановне, супруге герцога Карла Леопольда. Однако в Мекленбург был послан иеромонах Досифей (Любанский). В 1724 г., сменив иеромонаха Досифея, Иосиф служил настоятелем походной церкви герцогини Екатерины Ивановны, в 1725 г. вернулся в Россию и вновь возглавил Козелецкий монастырь. В 1733 г. Иосиф был почислен на покой с проживанием в Святогорском монастыре (по некоторым сведениям, несколько месяцев был настоятелем). По сообщению В. Левицкого, Иосиф был похоронен в Псково-Печерском в честь Успения Пресвятой Богородицы монастыре.