В Англии в защиту гильбертинцев выступили король Генрих II, Фома Бекет, архиепископ Роджер Йоркский, епископ Генрих Уинчестерский и др. В результате устав Ордена остался без изменений и был подтверждён папой, но «двойные монастыри» больше не основывались. Монастыри гильбертинцев (к тому времени их насчитывалось 28) прекратили существование в 1536–1540 гг., когда все монастыри в Англии были распущены. Гильбертинцы рассматривали свой Орден как провозвестник новой эры, который смог объединить в одно «чудесное целое» тех, кого общество разделило на мужчин и женщин, клириков, монахов и мирян, слуг и господ, управляющих и управляемых, грамотных и неграмотных. В то же время основой этого единства было самостоятельное функционирование каждой группы. Административное устройство Ордена описано в «Институциях» («Institutiones») начала XIII в. Они состоят из 12 глав и 100 статей. Во главе Ордена стоял главный магистр или главный приор, избиравшийся из каноников-гильбертинцев, которому было запрещено одновременно возглавлять какой-либо монастырь. Исключением стал св. Гильберт, принявший монашеский постриг незадолго до смерти. Ежегодно магистр объезжал все монастыри Ордена, вершил суд и надзирал за дисциплиной, рассматривал противоречивые и трудные дела. Магистр являлся единственным мужчиной в Ордене, которому дозволялось вести приватный разговор с сёстрами, с разрешения приорессы он имел доступ на женскую половину монастыря для совершения исповеди. Магистр обладал верховной властью в правовых и экономических делах Ордена. Его мог заменять главный исповедник, который объезжал все монастыри, исповедовал и разбирал самые серьёзные проступки. В управлении Орденом магистру помогали главные наблюдающие (scrutatores) или разъездные инспекторы (circatores): трое мужчин (два каноника и один брат-мирянин), которые посещали каждый монастырь, по крайней мере, раз в год, и три женщины (две грамотные монахини и одна неграмотная женщина, возможно, мирская сестра), которые посещали раз в год все монастыри, где были женщины. Они выслушивали жалобы, выносили решения и докладывали магистру и собранию общего капитула Ордена. Главных наблюдающих назначал магистр с согласия общего капитула. Также помощь в управлении магистру оказывали наблюдающие монастыря (scrutatrices claustri). В каждом монастыре магистр и главные наблюдающие назначали трёх монахинь, которые должны были информировать их обо всём, что происходило в обители. Им гарантировалась защита от вмешательства в их деятельность и от выговоров приорессы. Они могли исповедоваться непосредственно самому магистру. В мужской половине монастыря аналогичной должности не существовало. Женская часть монастыря управлялась приорессой, в каждом монастыре их было три, по очереди исполнявших эту должность. Если одна из них не могла исполнять свои обязанности, то её замещала субприоресса. Приорессу избирали монахини в течение 15 дней после смерти предшествующей. Если они не могли этого сделать, то её назначал сам магистр. Мужская половина монастыря управлялась приором. Ежегодно собирался генеральный капитул гильбертинцев, состоявший из шести инспекторов, главного исповедника, приора или келаря из каждого монастыря и двух приоресс из каждого «двойного монастыря».