Когда некоторые иноки стали роптать, опасаясь, что хлебных запасов не хватит для братии, Ефрем созвал старейших монахов и сказал: «Не знаю, как вы, а я расположился, доколе Богу будет угодно за наши грехи продолжать глад, обще с народом страдать, нежели оставить гибнуть от глада: какая польза пережить нам подобных людей? Из них, может быть, некоторые до сего глада и нас питали». Спустя неделю в пустынь приехал обоз с хлебом, «возов около 50, из какого-то селения, в коем селении, по сказанию извозчиков, их кто-то неизвестный человек нанял, хлеба на возы насыпал и за извоз заплатил, приказал в пустынь отвезть». Весной 1777 г. Ефрем заболел. В письме Владимирскому и Муромскому епископу Иерониму (Фармаковскому) просил освободить его от настоятельства, поскольку «пришёл в крайнюю слабость и телесное изнеможение». В марте 1777 г. Ефрем был уволен на покой. По его рекомендации 27 марта был избран, а 8 апреля того же года утверждён строителем пустыни иеромонах Пахомий (Леонов), «человек, вполне достойный, который потом и оправдал это доверие». По словам иеромонаха Авеля (Ванюкова), «смиренный, подвиголюбивый старец возлюбил совершенное безмолвие. Любимое его занятие было: уединённый труд в келье, безмолвная молитва и чтение духовных книг. Лобызая пустынную жизнь, он всегда поучал и братию быть ревностными любителями пустынного безмолвия». Ефрем скончался в день праздника Сошествия Святого Духа на апостолов, в год прибытия в Саров Прохора Мошнина, будущего преподобного Серафима Саровского. Ефрем похоронен рядом с Успенским собором, на западной стороне, слева от входа. После освящения собора 15 августа 1778 г. Владимирский епископ Иероним посвятил подвижнической жизни скончавшегося строителя особую проповедь. До закрытия пустыни в 1920 гг. по Ефрему служились соборные панихиды. К 1951 г. собор был взорван, захоронение подвижника утрачено. В Саровской Успенской пустыни хранился портрет Ефрема, предположительно последней трети XVIII в., с виршами: «Не Сирин ты, но Русский ты Ефрем; Саровской пустыни броня еси и шлем!» По мнению исследователей, этот ранний портрет воспроизведён на гравюре Ионы Шелковникова с цензорским разрешением 1849 г., выполненной в качестве отдельного листа (Исторический музей) и для книги: Авель (Ванюков), иеромонах. «Общежительная Саровская пустынь и достопамятные иноки, в ней подвизавшиеся» (М., 1853 г.). Ефрем представлен вполоборота вправо, по пояс, опирающимся на посох, в мантии и клобуке, с чётками в левой руке, с длинными волосами и окладистой, слегка раздвоенной седой бородой. Во второй половине XIX в. гравюра послужила оригиналом для повторений в технике литографии, помещённых в саровских изданиях (например, 1870 г. московской мастерской А.В. Морозова; музей Андрея Рублёва).