Танки из колонны имени Димитрия Донского участвовали в освобождении Украины, Белоруссии, Молдавии, Польши, в составе 516-го полка дошли до Берлина. Одновременно продолжался общецерковный сбор средств на авиаэскадрилью имени Александра Невского. Помимо этого православные верующие принимали активное участие в сооружении танков и самолётов по инициативе населения их областей, например, духовенство и верующие Новосибирска пожертвовали 110 тыс. руб. на строительство сибирской эскадрильи «За Родину». Архиерейский Собор РПЦ 8 сентября 1943 г. провозгласил в числе своих деяний «Осуждение изменников вере и Отечеству», согласно которому «всякий виновный в измене общецерковному делу и перешедший на сторону фашизма, как противник Креста Господня, да числится отлучённым, а епископ или клирик – лишённым сана». Собор единогласно избрал Патриархом Московским и всея Руси митрополита Сергия, интронизация состоялась 12 сентября в Богоявленском соборе Москвы. Проведение Собора и избрание патриарха способствовали восстановлению ранее прерванных связей с православными и инославными церквами. Поздравительные послания по случаю избрания нового Московского патриарха были получены от Константинопольского, Александрийского, Антиохийского и Иерусалимского патриархов. 19–28 сентября в Москве побывала делегация англиканской церкви во главе с архиепископом Йоркским Сирилом Фрстером Гарберттом. По мере наступления Красной Армии становились известными факты патриотических поступков духовенства и верующих на оккупированных территориях, где многие православные священнослужители и миряне были связными, соратниками, помощниками партизанских отрядов и групп подпольщиков, а сотни священнослужителей за свою патриотическую деятельность подвергались арестам, тюремным заключениям, истязаниям, были расстреляны или заживо сожжены. Начиная с осени 1943 г. к награждению государственными орденами и медалями стали представляться священнослужители и активные верующие. Первое большое награждение состоялось в Ленинграде, когда группа духовенства была награждена медалями «За оборону Ленинграда». В 1944 г. медалями «За оборону Москвы» были награждены священнослужители Московской и Тульской епархий. Всего за патриотическую деятельность сорок священнослужителей были удостоены медалей «За оборону Ленинграда» и «За оборону Москвы», более 50 – награждены медалью «За доблестный труд в Великой Отечественной войне», несколько десятков представителей духовенства награждены медалью «Партизану Великой Отечественной войны». После кончины патриарха Сергия, согласно его завещанию, в права Местоблюстителя Патриаршего Престола вступил митрополит Алексий, единогласно избранный на последнем заседании поместного Собора 31 января – 2 февраля 1945 г. Патриархом Московским и всея Руси. На Соборе присутствовали Александрийский патриарх Христофор II, Антиохийский патриарх Александр III и Грузинский патриарх Каллистрат (Цинцадзе), представители Константинопольского, Иерусалимского, Сербского и Румынского патриархов. 10 апреля 1945 г. И.В. Сталин принял делегацию РПЦ во главе с патриархом Алексием. На встрече обсуждались вопросы патриотической деятельности и внутренней жизни церкви, её возможное участие в укреплении международных отношений в послевоенный период.