Вскоре в скиту был построен и 14 сентября 1612 г. освящён храм. Антиминс подписал епископ Стагонский и Метеорский Авраамий, проживавший на покое в Дерманском монастыре. Преподобный Иов ввёл в скиту общежительный устав. Помимо участия в богослужениях братия в установленные часы занималась чтением Священного Писания и рукоделием. Иноки вкушали пищу лишь раз в день, в воскресенья и праздники дозволялись два постных блюда. Для бесед к основателю Манявского скита приходили и окрестные жители, в том числе православная шляхта. В 1613 г. в обитель прибыл представитель Александрийского патриарха Кирилла I Лукариса архидиакон Нектарий, который пригласил старца посетить патриарха и совершить паломничество ко Гробу Господню. После путешествия (по мнению исследователей, в том же году) преподобный Иов передал управление обителью Феодосию (Княгиницкому), рукоположённому в сан иерея, вручил ему игуменский жезл и дал монашеский устав Василия Великого. Назначение иеромонаха Феодосия настоятелем Манявского скита утвердили ктиторы обители – Ляхович и П. Дери-Кишка. Вскоре преподобный удалился из Манявского скита в пустынь, которая располагалась недалеко от скита. При игумене Феодосии в монастыре были построены кельи, в 1620–1621 гг. – каменная ограда с тремя оборонительными башнями, за которыми укрывались жители окрестных сёл во время нападений турок и татар. В 1619–1620 гг. в скиту была построена и 14 сентября 1620 г. освящена каменная церковь в честь Воздвижения Креста Господня. Образцом для неё послужил Преображенский собор Межигорского в честь Преображения Господня монастыря, который незадолго до этого посетил старец Иов. Крестовоздвиженский храм возведён на средства архимандрита Елисея (Плетенецкого) и Марии Могилянки, дочери молдавского господаря Иеремии Могилы. Перед кончиной преподобный Иов вернулся в скит. 31 декабря 1621 г. был погребён в притворе Крестовоздвиженского храма. В 1629 г. здесь же был похоронен игумен Феодосий (Княгиницкий). На надгробной мраморной плите были высечены изображения двух скитоначальников. В 1631 г. в Вене была изготовлена другая надгробная плита, из чёрного мрамора. К началу XVIII в. настоятели Иов и Феодосий почитались как «преподобные отцы блаженные старцы», о чём свидетельствует надпись 1705 г. на одном из образов в иконостасе Крестовоздвиженского храма. В 1620 г. Константинопольский патриарх Тимофей II предоставил Манявскому скиту ставропигию. В 1628 г. на Киевском Соборе скит получил статус прота – председательствующего монастыря воеводств Русского, Белзского и Каменец-Подольского. Согласно грамоте Станислава Потоцкого, датированной 12 июня (июля?) 1629 г., к Манявскому скиту были приписаны Угорницкая Михайловская, Тлумачская и Коломыйская Благовещенская и многие другие обители и храмы, а также обширные окрестные урочища с полями. В августе 1628 г. на Киевском Соборе Феодосий именовался как «игумен скитский и Угорник, прот монастырей воеводств Русского, Белзского и Подольского». Манявский скит был средоточием духовной жизни Галиции. В этот период в монастыре проживало около 200 монахов, была большая библиотека.