В сложившейся ситуации Амин Пьер Жмайель стал искать покровительства Сирии. По требованию Дамаска ливанский президент аннулировал договор с Израилем. Израильтяне продолжали отход до «зоны безопасности». В течение долгого времени юг Ливаан оставался ареной партизанской войны, которую вела против израильтян и их союзников из «Армии Южного Ливана» шиитская партия «Хизбалла», сформировавшаяся в конце 1982 г. в Баальбеке при поддержке Ирана. В отличие от более умеренной партии «Амаль» она стояла на консервативных фундаменталистских позициях и постепенно начала доминировать в шиитской среде Ливана. Вторая половина 1980 гг. стала пиком гражданской войны. Новые расколы прошли внутри каждой из этноконфессиональных групп. Отряды радикального палестинского лидера Абу Мусы при поддержке сирийцев к концу 1983 г. выбили из Бекаа и Триполи сторонников Арафата. Партия «Амаль» сражалась за контроль над южными пригородами Бейрута сначала с палестинцами (1985–1986 гг.), потом с «Хизбаллой» (1988–1989 гг.). В христианском лагере после смерти Пьера Жмайеля (1984 г.) центр силы переместился от политического руководства «Ливанских фаланг» к полевым командирам «Ливанских сил». Эта группировка, в свою очередь, раскололась на умеренных (Амин Пьер Жмайель, Элиас Хубейка), готовых поступиться доминированием христиан в системе власти и согласиться на сирийский протекторат, и непримиримых (Самир Джаджа), считавших подобные компромиссы предательством. Клановая разобщённость маронитов и их неспособность к консолидации стали главными причинами поражения христиан в войне. Летом 1988 г., накануне президентских выборов, в стране началось обострение политической обстановки. В маронитском лагере возвысился главнокомандующий армией генерал Мишель Аун. Он стремился отстранить от власти традиционных лидеров и полевых командиров, присвоивших государственные функции, и вывести страну из кризиса, опираясь на армию. Президентские выборы сорвались из-за отсутствия кворума. В ночь на 23 сентября 1988 г., накануне окончания своего президентского срока, Амин Жмайель назначил Мишеля Ауна премьером переходного правительства. Это означало нарушение традиции, согласно которой премьером должен быть суннит. Действующий премьер Салим аль-Хосс не признал полномочий Мишеля Ауна. В Ливане появилось два соперничавших правительства; аль-Хосса поддерживала Сирия, а Мишеля Ауна – Ирак, её главный геополитический конкурент в регионе. Мишель Аун контролировал только Восточный Бейрут и окрестности, но имел сравнительно большие воинские формирования и запасы оружия. Пытаясь поставить под своё командование «Ливанские силы», генерал вошёл с ними в конфликт, и партия перешла в оппозицию. В марте 1989 г. Мишель Аун объявил «освободительную войну» против Сирии.