Косма Фламиатос был тесно связан со знаменитой обителью Мегалу-Спилеу на Пелопоннесе, где благодаря деятельности рассеявшихся по всей Греции участников афонского филокалического возрождения духовная жизнь находилась на подъёме. Братия таких монастырей не только защищала православие, но и стремилась дать богословский отпор экспансии протестантских и католических миссионеров. Мегалу-Спилеу стал пристанищем для Космы Фламиатоса, из этой обители он отправлялся в миссионерские путешествия по городам и сёлам Пелопоннеса. В 1840 г. на Кефалинии была издана революционная антибританская прокламация (её составителем принято считать Косму Фламиатоса), тираж которой был конфискован полицией по приказу британской администрации Ионических островов. В 1841 г. в Патрах Косма Фламиатос издал 92-страничную брошюру, содержавшую новое прочтение «Откровений Агафангела», и Слово против антиправославной политики англичан на Ионических островах. Эта проповедь Космы Фламиатоса была зачитана во многих храмах Кефалинии его единомышленниками из среды духовенства. С 1845 по 1848 гг. Косма Фламиатос преподавал в Патрах и возглавил местное отделение возрождённого «Филортодоксального общества», начал выпускать журнал «Православное наставление» (с 1848 г.). В 1849 г. в Афинах Косма Фламиатос анонимно издал книгу «Православный глас, открывающий замысел против православных, здравомыслящий совет ради общего спасения и защиты от настоящей опасности. И о будущем положении дел». Его сторонники на местах образовывали братства, в которые входили выдающиеся общественные деятели, представители клира и монашества. Греческое правительство было недовольно и напугано успехом деятельности Космы Фламиатоса и его соратников. Вместе с ближайшим окружением (более 150 священников, монахов и мирян) он был арестован в 1852 г. и заключён под стражу в тюрьму в Рионе (недалеко от Патр). Спустя некоторое время Косма Фламиатос скоропостижно скончался, по мнению большинства историков, был отравлен. Незадолго до смерти он был пострижен в монахи. После того как ещё один близкий соратник Космы Фламиатоса умер в тюрьме, остальные его сподвижники были отпущены на волю. Суд над ними так и не состоялся. Константин Икономос называл Косму Фламиатоса «человеком Божьим, боголюбивым, подвижником Христовым». Его святая жизнь и жертвенное служение стали примером для десятков учеников, которым он передал свою деятельную и искреннюю любовь к церкви. Среди последователей Космы Фламиатоса исследователи выделяют фигуру игумена монастыря Мегалу-Спилеу Игнатия (Ламбропулоса), продолжившего дело своего учителя. Он также подвергся гонениям со стороны государства и длительное время провёл в заключении. Дружескими отношениями с Космой Фламиатосом были связаны Константин Икономос и известный исследователям странствующий проповедник монах Христофор Папулакос (Панайотопулос), мировоззрение которого сформировалось под воздействием проповедей и трудов Космы Фламиатоса.