К осени 1864 г. был построен каменный трёхэтажный корпус с домовой церковью во имя святителя Тихона и Владимирской иконы Божьей Матери в его северной части, освящённой валдайским архимандритом Лаврентием 1 октября 1865 г. К освящению митрополит Исидор (Никольский) прислал в дар обители икону святителя Тихона со своей подписью и два комплекта богослужебных книг. Антиминс для этой временной церкви был священнодействован 20 августа 1863 г. епископом Старорусским Герасимом (Добросердовым). Первая настоятельница общины монахиня Серафима, в 1865 г. переведённая из Зверина в честь Покрова Пресвятой Богородицы монастыря, через год и восемь месяцев вернулась в Зверин монастырь, скончалась в саратовском Покровском женском монастыре. К 1865 г. в общине насчитывалось больше 30 сестёр, в основном, вдов и сирот. В 1867–1871 гг., при управляющей рясофорной монахине Надежде (Кузминой), были завершены главные постройки обители. Она скончалась в рыбинском Софийском монастыре, приняв монашество с именем Назарета. В 1871–1879 гг., при третьей начальнице, монахине Анатолии (ум. в 1891 г.), было упорядочено церковное пение, устроены амосовские (духовые) печи в соборе, ферма и др. К 1871 г. пожертвованный капитал обители составил 88 547 руб. 28 февраля 1881 г. (последним указом императора Александра II перед гибелью) община была переименована в общежительный женский монастырь. Торжественное открытие состоялось 23 июня 1881 г. в присутствии новгородского губернатора Эдуарда Васильевича Лерхе и Н.В. Елагина. Божественную литургию совершил викарий Новгородской епархии епископ Старорусский Варсонофий (Охотин). Начальница общины с 1879 г., рясофорная послушница В. Макарова, была пострижена с именем Вера и 23 июня 1881 г. возведена в игуменский сан. В 1883 г. игуменью с двумя рясофорными послушницами приняли император Александр III и императрица Мария Фёдоровна, которым сёстры преподнесли два ковра, изготовленные в обители. 30 мая 1885 г. посетившему Короцкий во имя святителя Тихона Задонского женский монастырь великому князю Владимиру Александровичу вручили образ святителя Тихона и вышитое полотенце. В 1885 и 1887 гг. в обитель приезжал епископ Старорусский Анастасий (Добрадин), в 1888 и 1889 гг. – епископ Старорусский Владимир (Богоявленский). Игуменья Вера оформила для обители владение земельными участками, пожертвованными благотворителями, устроила небольшое помещение для больницы, открыла приют для девочек-сирот. После кончины в 1892 г. она была погребена напротив алтаря Тихоновского храма (на монастырском кладбище похоронен и её двоюродный брат генерал Иван Матвеевич Макаров). Со 2 августа 1892 г. Короцкий во имя святителя Тихона Задонского женский монастырь возглавляла рясофорная послушница Н.П. Тихонова (ум. 19 марта 1898 г.), 13 августа того же года валдайский архимандрит Леонид постриг её в монахини с именем Домника, 10 февраля 1893 г. указом Синода она была утверждена в должности настоятельницы. 22 мая 1894 г. епископ Кирилловский Арсений (Иващенко) возвёл монахиню Домнику в сан игуменьи.