В 1895 г. в Киевском университете была организована «Украинская студенческая громада», в неё входили Василий Николаевич Доманицкий, Борис Александрович Лазаревский и др. Студенты Киевского университета также были участниками нелегальных студенческих съездов 1898–1899 гг. В начале ХХ в. в Киевском университете действовали две библиотеки, две обсерватории, ботанический сад, девять клиник, девять лабораторий и учебно-вспомогательные учреждения, в том числе музей древностей, музей изящных искусств, нумизматический, минералогический, зоологический и другие кабинеты. Библиотечное собрание насчитывало около 300 тыс. томов (в том числе книги из виленских университета и академии, из коллекций княгини Радзивилл, Н.И. Костомарова, Н.Х. Бунге и др.; например, в 1868 г. фонд библиотеки Киевского университета составлял около 70 тыс. томов). При университете были организованы Историческое общество преподобного Нестора Летописца, Киевское общество естествоиспытателей, Киевское юридическое, Хирургическое, Химическое, Физико-математическое и Акушерско-гинекологическое общества. Летом 1915 г., во время Первой мировой войны, Киевский университет частично был эвакуирован в Саратов и возобновил свою деятельность только осенью 1916 г. Летом 1917 г. были открыты четыре новые кафедры. В 1918 г., при гетмане Павле Петровиче Скоропадском, Киевский университет получил официальный статус «российского университета Киева» (в это же время был создан и Украинский Киевский государственный университет). В 1919 г. оба учреждения объединились и перешли в подчинение Народному комиссариату просвещения УССР. Однако в 1920 г. университет расформировали, а из его структур были созданы Медицинский институт, Институт народного хозяйства, Высший институт народного образования имени Михаила Петровича Драгоманова (с 1926 г. – Киевский институт народного образования). В 1933 г. Киевский государственный университет был возрождён. С 1935 г. началось издание научных периодических журналов и сборников. В 1938 г. в составе Киевского университета было уже восемь факультетов. В 1939 г. университету было присвоено имя Т.Г. Шевченко. Часть преподавательского состава была репрессирована (профессора Николай Константинович Зеров, Иосиф Юрьевич Гермайзе, Сергей Александрович Ефремов, Агафангел Ефимович Крымский и др.). В 1941–1944 гг. Киевский университет находился в эвакуации в городе Кзыл-Орда (ныне Кызылорда) в Казахстане, где вместе с Харьковским государственным университетом входил в Объединённый украинский государственный университет. С 1944 г. занятия проводились в Киеве. В новом учебном году возобновилась деятельность 80 кафедр. Тогда же был создан факультет международных отношений (на базе существовавшего с 1919 г. Киевского техникума международных отношений). В 1958 г. в Киевском университете действовали 11 факультетов. С 1959 по 1984 гг. было подготовлено около 70 тыс. специалистов. 21 апреля 1994 г. по указу Президента Украины Киевскому университету был присвоен статус национального. В 2013 г. в составе Киевского университета было 16 факультетов, семь институтов, астрономическая обсерватория, ботанический сад, Каневский биосферный заповедник, научная библиотека и др. С ХIХ в. в Киевском университете формировалось и развивалось светское направление изучения истории церкви. Ректор университета М.А. Максимович первым на Украине сформулировал основные темы и задачи этого направления, которые нашли отражение в его работах. Впоследствии этот метод получил развитие в трудах профессора истории Владимира Бонифатьевича Антоновича (1834–1908 гг.). С его именем связано создание так называемой Киевской исторической школы, к которой принадлежали также Дмитрий Иванович Багалей, Михаил Сергеевич Грушевский, Пётр Васильевич Голубовский, Иван Андреевич Линниченко и др.