Во время Первой мировой войны Каллиник в качестве митрополита Веррийского стал членом архиерейского Совета в Фессалонике, который управлял епархиями Константинопольского патриархата на присоединённых к Греции территориях. Являлся последовательным сторонником премьер-министра Греции Элефтериоса Венизелоса. На Высшем церковном суде в августе-ноябре 1917 г. Каллиник выступил за низложение Афинского митрополита Феоклита I (Минопулоса) и ряда архиереев, которые были инициаторами предания анафеме Э. Венизелоса в декабре 1916 г. В 1922 г. Каллиник опубликовал доклад о неканоничности извержения из архиерейского сана Священным Синодом Элладской православной церкви Афинского митрополита Мелетия (декабрь 1921 г.), ставшего к тому времени Константинопольским патриархом (см. в ст. Мелетий IV (Метаксакис)). Сохранилась переписка Каллиника с Э. Венизелосом, который в 1922 г. предлагал перенести патриаршую резиденцию в Фессалонику, из-за того что в условиях, сложившихся во время второй греко-турецкой войны, работа патриархии в Константинополе была невозможна. Но Каллиник и Василий (Георгиадис), митрополит Никейский (в 1925–1929 гг. – Константинопольский патриарх Василий III), считали недопустимым перенесение кафедры Константинопольского патриархата из Стамбула. Каллиник был представителем Константинопольского патриархата и заместителем председателя на «Всеправославном конгрессе» (май-июнь 1923 г.); участвовал в догматическо-канонической комиссии «Всеправославного конгресса» и отстаивал календарную реформу, утверждая, что переход православных церквей на новый стиль не имеет связи с догматами, а представляет собой чисто астрономическую проблему. Каллиник также был в числе сторонников реформы брачного права для духовенства и выступал за сближение православной церкви с Англиканской церковью и старокатоликами. В периоды межпатриаршества Каллиник неоднократно председательствовал в Синоде (2 октября – 6 декабря 1923 г.; 17–24 ноября 1924 г.; 29 сентября – 7 октября 1929 г.). Последние годы жизни провёл в Константинополе на острове Халки. Похоронен на кладбище монастыря иконы Божьей Матери «Живоносный Источник» в Балыклы.