Во второй половине 1940 гг. с Илори были связаны грузинские подвижники архимандрит Иоаким (Шенгелия), монах Георгий (Булискерия), монах Амвросий (Гвазава), архимандрит Константин (Кварая); в Илори подвизалась монахиня Мария (Добрынина) и др. Их жизнь и духовные подвиги описал архимандрит Рафаил (Карелин) в книге «Тайна спасения: Беседы о духовной жизни». Об архимандрите Иоакиме, восстановителе и настоятеле Илори в послевоенные годы, исследователям известно, что, будучи сам болен воспалением лёгких, он пошёл в дальнее селение причащать больного; поднявшейся от дождей рекой смыло мост, монах был вынужден перейти её вброд. Архимандрит Иоаким причастил больного и вернулся в Илори, но через несколько дней умер. Монах Георгий, воспитанник Алексия (Шушаниа), подвизался в выстроенной в горах келлии и непрестанно творил Иисусову молитву. Достигнув преклонных лет и не имея возможности часто спускаться в село, он по предложению архимандрита Иоакима обосновался в Илори и принял подвиг старчества (позже в схиме Гавриил). Погребён в ограде Илори недалеко от входа в храм. После архимандрита Иоакима настоятелем Илори стал архимандрит Константин; в 1980 гг. – священник Цхалоба Чулухадзе. В 1953 г. Илори была отремонтирована, в 1959 г. восстановлена церковная ограда. В 1970–1980 гг. Илори оставалась одной из пяти действующих церквей Абхазии (остальные – сухумский кафедральный собор в честь Благовещения, церкви в городе Гагра, городе Гадаута и селе Тависуплеба). 8 апреля 1981 г. Илори посетил Католикос-Патриарх Грузии Илия II (Гудушаури-Шиолашвили). Реставрация и переделка Илори проводились во второй половине 1980 гг. и в начале 1990 гг., но не были завершены вследствие военных действий в Абхазии в 1992–1993 гг., когда грузинский клир покинул Илори. В настоящее время богослужение совершает абхазский священнослужитель. В храме идут реставрационные работы. В архитектурный комплекс Илори входят церковь и несколько подсобных строений. Территория Илори находится за булыжной оградой, над воротами – колокольня. Первоначальная церковь представляла собой однонефное, выстроенное из булыжника здание с двускатной крышей (11,5х7,5 кв. м, высота 10 м). Её облик вследствие поздних переделок существенно изменился. С юга к храму был пристроен притвор, покрытый тёсаным камнем; с севера и запада в разное время возвели два придела, что увеличило площадь церкви (22х14 кв. м). Фасад южного притвора декорирован; остальные наружные поверхности стен церкви оштукатурены и выбелены известковым раствором. Храм однозальный, с внутренним алтарным полукружием и с прямоугольным высоким окном в центре. Основное помещение, перекрытое каменным сводом на арках, опирается на выступающие из стен массивные пилястры. Церковь освещается шестью симметрично расположенными окнами: по два находятся с северной и южной сторон, по одному – с восточной и западной. В 1954 г. Илори была расписана масляными красками, о чём была сделана соответствующая запись на стене южной пристройки.