Открыты домовые храмы в колонии станции Каркалай Увинского района, в воинской части посёлка Пибаньшур Балезинского района, больничные храмы в медсанчасти «Ижмаш» Ижевска и в городской больнице Воткинска. Капитально отремонтировали храмы в сёлах Чутырь (Игринский район), Мостовое, Мазунино, Нечкино (Сарапульский район), Валамаз (Селтинский район), Ёжево (Юкаменский район), Укан (Ярский район), Сюмси (Сюмсинский район). В 1990 гг. были созданы первые в истории епархии монастыри: Покровая Пресвятой Богородицы близ села Каменное Заделье Балезинского района (1993 г.), Успения Пресвятой Богородицы в селе Перевозном (1994 г.), Мало-Дивеевский Серафимовский (1998 г.). Идёт строительство Ризоположенского женского монастыря в селе Люк Завьяловского района. При Ижевском епархиальному правлении действуют отделы: религиозного образования и катехизации, взаимодействия с Вооружёнными Силами и правоохранительными учреждениями, социального служения и церковной благотворительности, миссионерский, по делам молодёжи, культуры. Открыты вечерние катехизаторские курсы, воскресная школа, учебно-методический центр для содействия приходским воскресным школам. Епархия издаёт газету «Православные вести», молодёжный журнал «Сретение», военно-патриотический молодёжный журнал «Витязи» (при одноимённом православном военно-патриотическом клубе). Продолжается перевод Священного Писания, богослужебных книг и духовной литературы на удмуртский язык. При помощи Института перевода Библии (Хельсинки) на удмуртском языке изданы Новый Завет, Псалтирь, Детская Библия. 25 декабря 2005 г. была совершена первая литургия на удмуртском языке в Крестовоздвиженском храме Ижевска, богослужения на удмуртском языке совершаются в Казанско-Богородицком храме Михайловского собора. В начале 1990 гг. появились условия для восстановления социального служения церкви, и в 1991 г. группа верующих в Ижевске образовала братство исповедника Сампсона, вскоре распавшееся. Возрождение братства с посвящением князю Александру Невскому произошло по благословению архиепископа Николая (Шкрумко). Члены братства осуществляют попечение над больницами, детскими домами, домами для престарелых. Братство организует паломничества в св. места России, устраивает субботники на городских кладбищах. В епархии возродилась традиция крестных ходов. С 1993 г. 17 июля, в день мученической кончины царской семьи, совершаются шествия к Красной горке в Ижевске (в настоящее время там расположен возрождённый Михайловский собор). Через территорию епархии проходили всероссийские и региональные крестные ходы: Салехард – Москва к 2000-летию христианства (1999 г.), покаянный крестный ход памяти царственных мучеников Екатеринбург – Кострома (2002 г.). Решением Священного Синода от 25–26 декабря 2013 г. из состава Ижевской и Удмуртской епархии были выделены Глазовская и Сарапульская епархии. Ижевская и Удмуртская епархия включена в состав Удмуртской митрополии.