В 1754 г. в любечском Антониевом мужском монастыре была построена и освящена церковь во имя святых Иоакима и Анны, в Успенском соборе Каменского монастыря сооружён величественный пятиярусный иконостас, шло строительство тёплой трапезной церкви во имя Иоанна Предтечи. После пожара, который случился в июле 1754 г. в Рыхловском во имя Николая Чудотворца монастыре, по благословению Ираклия была составлена и отправлена в Синод подробнейшая опись всех сгоревших и немногих уцелевших построек и имущества обители. В феврале 1755 г. архиерей добился разрешения Синода рыхловскому игумену Герману (Мировицкому) производить сбор милостыни во всех российских городах. Вскоре в этом монастыре был заложен новый каменный трёхпрестольный пятиглавый Никольский собор, который Ираклий освятил в 1760 г. Одновременно в Рыхловском монастыре инициировал ремонт единственной сохранившейся во время пожара церкви во имя Феодора Стратилата, а также строительство каменной церкви во имя Иоанна Предтечи (1767 г.). В Чернигове в 1754 г. освятил после ремонта древнейший собор Преображения Господня, в 1755 г. восстановил пострадавший от пожара 1750 г. Пятницкий храм одноимённого девичьего монастыря. При Ираклии в епархии было построено несколько храмов, в том числе апостола Иоанна Богослова (1752 г.) и Преображения Господня (1757 г.) в городе Нежине, собор Рождества Пресвятой Богородицы (1752–1762 гг.) в Козельце, храмы святителей Василия Великого, Григория Богослова и Иоанна Златоуста (1755 г.) в селе Лемеши, проролка Илии в Коропе и др. В 1754 г. Медицинская канцелярия предложила Ираклию, а также Киевскому митрополиту Тимофею (Щербацкому), Белгородскому Иоасафу (Горленко) и Переяславскому епископу Иоанну (Козловичу) направить несколько семинаристов для обучения хирургии и «фармации» в казённых госпиталях и аптеках. В 1755 г. Ираклий избрал и послал в Санкт-Петербургский адмиралтейский госпиталь четырёх студентов Черниговского коллегиума. 20 августа 1755 г. в киевском Софийском соборе Ираклий вместе с Киевским митрополитом Тимофеем участвовал в хиротонии архимандрита Георгия (Конисского) во епископа Могилёвского. После того как императрица Елизавета Петровна уволила священника Каргопольского гренадёрского полка Иванова от служения, 20 января 1759 г. Синод поручил Ираклию избрать в Черниговской епархии достойного кандидата на этот пост. 27 февраля того же года епископ рапортовал о назначении в Каргопольский полк овдовевшего бездетного протопопа Крестовоздвиженского храма Василия Артёмова. За финансовые растраты и «неумеренные поступки» Ираклий отстранил от настоятельства в новгород-северском в честь Преображения Господня монастыре архимандрита Сосипатра (Карповича; ум. в 1769 г.).