С января 1945 г. И.М. Кополович был назначен главой чрезвычайной комиссии по учёту вреда, расследованию и установлению преступлений, совершённых немецко-венгерскими оккупантами в Закарпатье. 22 октября 1945 г. Мукачевская епархия в составе земель, вошедших в СССР, перешла в юрисдикцию РПЦ. В 1946 г. был утверждён Мукачевским и Ужгородским епископом Нестором (Сидоруком) в должности секретаря епархиального управления. В 1947 г. возведён в сан протоиерея. 11 ноября 1949 г. Священный Синод РПЦ под председательством Патриарха Московского и всея Руси Алексия I объединил венгерские православные приходы, не состоящие в чьей-либо юрисдикции или потерявшие за время войны русскую юрисдикцию, во «Временное управление венгерских православных приходов». Протоиерей И.М. Кополович был назначен руководителем управления со статусом благочинного-администратора и полномочным представителем Московской патриархии во всех организациях Венгерской Народной Республики с оставлением за ним должности секретаря Мукачевского епархиального управления. Православным венграм было предоставлено право совершения всех служб и треб на венгерском языке. Соборным храмом Венгерского благочиния была определена церковь Успения Пресвятой Богородицы в Будапеште. Под руководством протоиерея И.М. Кополовича начался перевод и подготовка к изданию на венгерском языке церковных и богослужебных книг. В том же году патриарх Алексий I наградил И.М. Кополовича наперсным крестом с украшениями. В ноябре 1950 г. в Будапешт прибыл Пражский и Чешский митрополит Елевферий (Воронцов) и рукоположил новых священнослужителей для Венгерского благочиния. 10–31 августа 1951 г. И.М. Кополович организовал курсы для священно- и церковнослужителей с целью расширения богословских познаний и укрепления богослужебных навыков слушателей. Были открыты новые храмы и приходы, улучшена материальная жизнь духовенства. В 1952 г., согласно ходатайству протоиерея И.М. Кополовича, был начат выпуск православного ежемесячного журнала на венгерском языке «Церковная летопись». 21 января 1954 г. протоиерей И.М. Кополович был награждён правом ношения двух наперсных крестов с украшениями. 30 июля 1954 г., согласно прошению, был уволен с должности благочинного венгерских православных приходов. С 15 декабря 1954 г. И.М. Кополович – настоятель кафедрального собора в Мукачеве и секретарь епархиального управления. 10 июня 1955 г. направлен в распоряжение Митрополичьего совета православной церкви в Чехословакии и назначен генеральным викарием Прешевской православной епархии. Был награждён орденом святых Кирилла и Мефодия третьей степени и правом совершения Божественной литургии при открытых царских вратах до Херувимской песни. В 1955 г. патриархом Алексием I награждён митрой. В 1961 г. окончил Прешевский богословский православный факультет.