Правительство применяет пять критериев для официального признания религиозных организаций: наличие структуры и иерархии; наличие достаточного количества членов; длительное существование на территории Бельгии; представление социальной ценности для общества; соблюдение законов государства и общественного порядка. Эти критерии указаны в постановлении кассационного суда от 1834 г. о том, что никакие субъективные ценности не должны использоваться при определении того, что составляет религию. Если религия не признана Министерством юстиции, решение может быть обжаловано в Государственном совете. Отсутствие статуса «признанной» не запрещает членам организации свободно вести религиозную деятельность. В 1999 г. Евангелистская ассоциация объявила о дискриминации по причине отказа правительства предоставить ей статус «признанной» отдельно от признанной в 1831 г. протестантской конфессии. Нерелигиозные философские организации (libres penseurs) являются седьмой признанной «религиозной общностью»: их организационная структура – Центральный совет нерелигиозных философских общин Бельгии получает средства и имеет привилегии, равные тем, что имеют шесть признанных государством религий и конфессий. По данным правительства, такие организации объединяют 12% населения. Правительство Бельгии предпринимает действия против групп, которые рассматриваются как «секты, причиняющие вред». В 1997 г. парламентская комиссия, созданная правительством для выработки мер по противодействию потенциальным опасностям со стороны сект, опубликовала отчёт, в котором секты были подразделены на две категории. Ко второй категории относятся сектантские организации, приносящие вред, они определены как «группы, имеющие или претендующие на философскую или религиозную цель, но чья практика нарушает закон и приносит вред индивидам или обществу или наносит ущерб человеческому достоинству». К отчёту был приложен список из 189 сектантских организаций, ни одна из которых не характеризовалась как «приносящая вред». В мае 1998 г. парламент принял закон о создании Информационного центра по вопросам сектантских организаций, приносящих вред. Центр начал сбор информации по широкому кругу религиозных и философских групп. В декабре 1998 г. парламент принял закон, обязывающий службу государственной безопасности Бельгии рассматривать приносящие вред сектантские организации как представляющие потенциальную опасность для государства.