После создания второго Болгарского царства со столицей в Тырнове (1186–1396 гг.) была учреждена Тырновская архиепископия. Бдин в этот период был важнейшей крепостью и торговым центром на северо-западе Болгарии. Видинский митрополит осенью 1186 (или 1187) г. участвовал в хиротонии во епископа иерея Василия, ставшего затем первым Тырновским архиепископом. Тогда же Видинская епархия перешла из юрисдикции Охрида в подчинение Тырнову. После признания Константинопольским патриархом Иоанном X Каматиром статуса Тырновской архиепископии архиепископ Василий рукоположил во митрополита Видинского некоего Стефана. Богослужение перешло на славянский язык, в епархии было открыто училище, и кафедре было возвращено наименование Бдинская. При царе Константине Асене Тихе (1257–1277 гг.) Бдин и соседние с ним области были завоёваны венграми и преобразованы в деспотат, во главе которого был поставлен русский по происхождению князь Иаков Святослав. Поскольку Венгрия поначалу была союзницей Византии, отношения Бдинского митрополита и Тырновского патриарха, как полагают исследователи, были временно прерваны. Но когда в 1265 г. союз Венгрии и Византии распался, отношения Бдина и Тырнова восстановились. При Георгии Тертере I (1280–1292 гг.) Болгарию захватили монголо-татары, и Видин стал самостоятельным феодальным княжеством под властью деспота Шишмана, во время правления которого епархия временно вновь была подчинена Константинополю. Преемник Шишмана Михаил стал болгарским царём (1322–1330 гг.), и епархия вернулась в юрисдикцию Тырнова. В середине XIV в. царь Иоанн Александр разделил Болгарию на два удела: Тырновским управлял вместе со своим сыном Иоанном Шишманом, а Видинский передал старшему сыну Иоанну Срацимиру. Благодаря деятельности Иоанна Александра и его сыновей в Болгарии, в том числе и в Видине, строились и украшались храмы и монастыри. От этого времени сохранилось несколько рукописей, переписанных в Видине: Четвероевангелие середины XIV в., переписанное по заказу Видинского митрополита Даниила (как полагают исследователи, около 1348 г.); так называемый Бдинский сборник (Бельгия, Гент, библиотека университета), копия конца XIV в. сборника Житий св. жён, написанного в 1360 г. для царицы Анны, супруги Иоанна Срацимира; два сохранившихся листа Апостола, написанного в 1365–1368 гг. и до начала XX в. хранившегося в библиотеке монастыря св. Павла на Афоне (Библиотека Академии Наук); Апостол 1428 г. В 1365 г. Бдин захватили венгерские войска короля Лайоша I (Людовика Великого): было создано Видинское банство, учреждено Видинское католическое епископство, и поставлена венгерская администрация, проводившая политику окатоличивания местного населения. В 1369 г. благодаря сопротивлению болгарского населения Иоанн Срацимир смог вернуться из плена в Видин. Из-за возникших противоречий между братьями Иоанном Срацимиром и Иоанном Шишманом первый, несмотря на протесты Тырновского патриарха Евфимия, передал в 1381 г. Бдин в ведение Константинопольского патриарха и попросил поставить на кафедру вместо бежавшего в Валахию при венгерском завоевании митрополита Даниила своего ставленника – иеромонаха Кассиана.