Житие свидетельствует, что папа Римский просил Иерусалимского патриарха прислать знающих и мудрых людей, чтобы помочь Римской церкви бороться с франками, сделавшими своевольное прибавление к Символу веры. В то же время арабы стали требовать от палестинских церквей и монастырей непомерную подать, и патриарх Фома I хотел просить финансовой помощи как у папы Римского, так и у Константинопольского патриарха. Житие утверждает, что это был иконоборческий патриарх Феодот I, однако из других источников исследователям известно, что Михаил Синкелл, Феодор и Феофан прибыли в Константинополь в правление императора Михаила I Рангаве (811–813 гг.), когда патриархом был Никифор I. Посланцы были приняты радушно и поселены в монастыре Хора. По каким-то причинам они не отправились дальше в Рим, как первоначально намеревались. Очень скоро Михаила I сменил император Лев V, который в 814 г. начал возобновлять иконоборчество. Михаил Синкелл был заточён в тюрьму Фиала в Константинополе, где пробыл до убийства Льва V на Рождество 820 г. После этого он жил в одном из монастырей на Вифинском Олимпе, в районе Прусиады. На пятый год правления императора Феофила (834 г.) его снова доставили в Константинополь и бросили в тюрьму Преторий. Оттуда он был освобождён после смерти Феофила в январе 842 г. и принял активное участие в восстановлении иконопочитания. Патриарх Мефодий I назначил его своим синкеллом и игуменом монастыря Хора, где Михаил Синкелл и скончался 4 января 846 г. Наибольшую известность (в том числе в славянском мире) получило сочинение Михаила Синкелла «Слово о православной вере». Кроме того, славянам были известны, по крайней мере, три антилатинских сочинения, приписываемые Михаилу Синкеллу, под заглавием «Изложение православной веры». Под именем Михаила Синкелла сохранился трактат о греческом синтаксисе. Кроме того, сохранились четыре канона и анакреонтики, посвящённые празднику Торжество Православия. В источниках упоминаются утраченные сочинения Михаила Синкелла: например, Георгий Монах цитирует некий краткий трактат, посвящённый Мухаммаду и описывающий происхождение ислама. Михаил Синкелл перевёл на греческий язык послание о вере к армянам, написанное по-арабски Феодором Абу Куррой по заказу Иерусалимского патриарха Фомы. Многочисленные агиографические произведения, надписанные именем Михаила Синкелла, принадлежат другому автору, с тем же именем Михаил Синкелл, но они были написаны на несколько десятилетий позже. Михаилу Синкеллу принадлежат также отдельные богослужебные сочинения.