Тогда Арминий отправил Макария к Евтихиану, правителю селения Пшати (греч. Никиу). Здесь Макарий совершил чудо воскрешения мертвеца, затем снова был подвергнут пыткам. В это время все правители египетских областей по приказу Диоклетиана съехались в Александрию. На обратном пути правитель Фиваиды Ариан остановился в Пшати, где Евтихий передал ему Макария. Корабль Ариана с мучеником на борту пристал к берегу близ селения Шетнуфи (ныне Шатануф, мухафаза Минуфия, Египет). Христос явился Макарию и пообещал ему «вписать в книгу жизни» всякого, кто опишет его мученичество, построит храм в его честь, поможет нуждающимся в память о нём или призовёт его имя в беде (так называемый завет святому – распространённый мотив коптской и эфиопского агиографии). Макария опять пытали, после чего по приказу Ариана ему отрубили голову. Далее в «Мученичестве» следует пространный эпилог, повествующий о приходе к власти императора Константина I Великого и об обретении мощей Макария. Диоклетиан был отстранён от власти сенаторами и военными из-за того, что ослеп. Новый император Константин приказал уничтожить идолов, разрушить капища, освободить христиан из заточения и построить храмы в честь мучеников. Однако в Александрии правитель был язычник (по имени не назван). Он не позволял открывать церкви, и христиане пожаловались Константину. Тот послал эпарха Евлогия, брата Макария, наказать всех язычников «от антиохийского дворца… до эфиопской земли» (в других текстах братом Макария М. назван мученик Евсевий (память в Коптской церкви 23 амшира)). Евлогий исполнил приказание императора и убил нечестивых правителей. По пути эпарх оказался в Шетнуфи, где узнал о судьбе брата. Он решил перенести мощи Макария в Антиохию, но мученик, явившись ему, запретил это делать и повелел построить храм в его честь на том месте, где ему отрубили голову. Евлогий выполнил просьбу брата. В средневековом сочинении «Церкви и монастыри Египта и соседних земель» отмечается, что мощи Макария хранятся в районе Шмуна (греч. Великий Гермополь, араб. Эль-Ашмунейн). Перед церковью монастыря Дейр-Абу-Хиннис, находящегося в той же области, на скале вырезана эпитафия на коптском и гречском языках о том, что здесь, «в месте святого апы Макария», похоронен некий Папий.