Макарий I пресёк и попытки мещан назначить настоятеля Троицкого монастыря. Таким образом, принимались меры для усиления власти митрополита в столице Великого княжества Литовского. В 1495 г. Макарий I возглавил в Вильно хиротонию Луцкого епископа Кирилла. Хотя митрополия носила название Киевской, и в Киеве у митрополичьей кафедры были владения и доходы, митрополиты второй половины XV в. практически не бывали в её официальном центре. Местное духовенство оказалось в тяжёлом положении, когда в начале 1480 гг. Киев взяли татары и разорили Киево-Печерский монастырь и собор Святой Софии. Весной 1497 г. Макарий I направился в Киев, «хотя помощи церкви Божыи Софии». Во время правления Макария I татары часто совершали набеги на Киев и прилегавшую к нему территорию. Так, они «плениша усю Волыньскую землю мало не до конца», сожгли в 1496 г. Жидичинский во имя святителя Николая Чудотворца мужской монастырь. 1 мая 1497 г. Макарий I был убит крымскими татарами по дороге в Киев, у села Стриголова, в пяти милях от Мозыря (ныне деревня Скрыгалов Мозырского района Гомельской области), погибли или были взяты в плен его сопровождающие. Останки митрополита были привезены в Киев и положены «открыто» в Софийском соборе Киева. Нетленные мощи священномученика издавна почитались. Святым называет Макария I киево-печерский архимандрит Захария (Копыстенский) в «Палинодии» (1621 г.; «В церкви Святой Софии тело с отсеченою от татар головою лежит св. Макария, митрополита Руского» («Русская историческая библиотека», том 4). По сообщению монаха Афанасия Кальнофойского («Тератургима». Киев, 1638 г.), у раки Макария I были зафиксированы два чуда, которые произошли в 1625 и 1634 гг. К 1836 г. мощи находились «под сению, в правой стороне Софийского собора в раке, серебром обложенной». В доме Киевских митрополитов в XIX в. была домовая крестовая церковь во имя Макария I. Придел во имя Макария I был освящён в восстановленном по инициативе Виленского генерал-губернатора Михаила Николаевича Муравьёва в 1865–1868 гг. виленском Пречистенском соборе. По сообщению епископа Димитрия (Самбикина; 1899 г.), «в прежнее время память святителя Макария совершалась 19 января, в день преподобного Макария Египетского, ради тезоименитства, но с 1827 г. память святителя Макария перенесена на 1 мая (день его кончины); в этот праздник мощи святителя обносятся вкруг Киево-Софийского Собора». В кон. XIX – начале XX вв. о присуждении особой премии митрополита Макария (Булгакова) за лучшие сочинения студентам Киевской духовной академии объявлялось в день памяти Макария I 1 мая. В настоящее время мощи священномученика Макария I покоятся во Владимирском соборе Киева (неканонической Украинской православной церкви Киевского патриархата), частица мощей – в посвящённой Макарию I киевской церкви на Татарке Украинской православной церкви. Ежегодно 14 мая в деревне Скрыгалов после литургии совершается крестный ход от церкви к месту мученической кончины Макария, где у стелы служат молебен святому.