Как чудотворный почитался также запрестольный образ Божьей Матери «Одигитрия». О нём рассказывает первое чудо под названием «Чудо Пресвятыя Богородицы о исцелении болящия» из «Сказания о явленной иконе Рождества». В 1653 г. по молитвам у запрестольной иконы исцелилась жительница села Авксентьева Александровского уезда Антонина и в благодарность «положила убрус» (Исторический музей). В 1833 г. образ был украшен серебряной позолоченной ризой. В часовне преподобного Лукиана на гробнице святого находилась икона с изображением преподобного в рост (литографии с иконы были сделаны в конце XIX в. попечением Н.С. Стромилова). В 1916 г. был написан новый надгробный образ святого Лукиана. До 1917 г. мощи преподобного оставались под спудом, в 1992 г. состоялось их обретение, к 2016 г. мощи преподобного Лукиана находились в храме Богоявления. Незадолго до закрытия пустыни, в 1920 г., сюда поступил и был здесь пострижен в монашество преподобный Иличя (Вятлин; ум. в 1938 г.). В 1922 г. Лукианова пустынь была закрыта, в 1924 г. в храме Богоявления размещена школа, в 1925 г. в Екатерининской церкви – клуб. Позднее в монастыре была устроена тюрьма. В 1970 гг. в зданиях обители размещались дом инвалидов и больница. 12 мая 1991 г. Лукианова пустынь была возобновлена, после многолетнего перерыва состоялся первый крестный ход в обитель со списком иконы Рождества Пресвятой Богородицы, шествие возглавил епископ Владимирский и Суздальский Евлогий (Смирнов). 25 октября 1999 г. в Лукиановой пустыни по благословению патриарха Алексия II (Ридигера) был принесён со Святой Горы Афон образ Божьей Матери «Игумения Святой Горы Афон». К 2016 г. в обители проживали несколько насельников, наместник – игумени Тихон (Шибеко).