В Средние века в окрестностях аббатства находилось семь капелл, из которых сохранились три (известная исследователям по упоминаниям в источниках капелла святого Михаила разрушена, капеллы святого Петра, святого Капразия и святых Киприана и Иустины реконструированы в XX в.). Расположенная поблизости от монастыря капелла святого Поркария – простое однонефное сооружение с апсидой и округлым оконным проёмом на западном фасаде. Средневековая капелла Святой Троицы состоит из прямоугольной основной части и примерно равной ей по площади алтарной части в форме триконха. Капелла Спасителя – октагон (диаметр около 8 м), из его восточной грани выступает небольшая апсида. В интерьере семи граней октагона отмечены полуциркульными нишами; в стене над западным входом прорезано округлое окно. По одной из версий, капелла относится к эпохе Каролингов, по другой – к XI в. При археологических раскопках под капеллой были обнаружены остатки построек, восходящих к начальному этапу истории монастыря. В V в. на этом месте был возведён небольшой ораторий (молельня) со зданием из нескольких комнат, одна из которых служила кухней. По мнению исследователей, это была келья отшельника. В VI–VII вв. на месте жилых помещений возвели пристройку с гробницей (скорее всего, по мнению исследователей, там был похоронен чтимый подвижник, живший в келье); внутри и снаружи оратория найдены захоронения. Исследователи интерпретировали эти данные как свидетельство укрепления монашеского общежития: кельи, где раньше жили аскеты, становились местами их почитания, а монахи собирались в монастыре. ио мнению исследователей, в VIII в. в оратории и пристройке поселились люди; это могло быть связано с временной оккупацией острова сарацинами. В эпоху Каролингов, когда монашеская жизнь возобновилась, здесь была построена новая небольшая церковь. Главной святыней Лерана считались мощи святого Гонората, вскоре после перенесения в монастырь (1392 г.) разделённые на несколько частей; их поместили в реликварии, изготовленные на средства монаха Жана Ложье, приора Валлориса. Череп святого хранился в серебряном бюсте-реликварии, основная часть мощей – в деревянной раке, украшенной резными сценами жизни и чудес святого. В 1485 г. руку святого Гонората поместили в серебряный реликварий в форме руки, а в 1491 г. аббат Ж.А. Гримальди подарил Лерену серебряную раку для мощей, в которой они хранились до XVIII в. В 1788 г., после закрытия Лерена, епископ Франсуа д'Этьен де Сен-Жан де Прюньер распределил монастырские реликвии между церквами диоцеза Грас. Бюст-реликварий святого Гонората и резную раку с его мощами поместили в соборе Нотр-Дам-дю-Пюи в Грасе; там же хранился серебряный бюст-реликварий святого Айгульфа (реликварии, выполненные из драгоценных металлов, были утрачены в 1792 г.). Серебряная рака, подаренная Ж.А. Гримальди, была передана в приходскую церковь в Каннах (сохранился деревянный ковчег, находившийся внутри раки; в 2006 г. в нём были обнаружены частицы мощей святого и средневековые ярлыки с указаниями на принадлежность). В Мужене находится реликварий 1485 г. с рукой Гонората, в Орибо-сюр-Сьянь – серебряный реликварий конца XV в. с челюстью святого. В XX в. из Граса в аббатство Лерен была возвращена часть мощей святого Гонората.