Боковые фасады восходят к работам А. Палладио, имея аналогичный центральный элемент фасада, применённый в проекте виллы Дзено в Чессальто (провинция Тревизо). Фасад церкви в Волгове очень похож на карандашный рисунок Дж. А. Кваренги с вариантом перекрытия центрального зала «виллы» (библиотека А. Май в Бергамо). В Царском селе Дж. А. Кваренги построил павильон «Концертный зал» (1782–1786 гг.) и Александровский дворец (1792–1796 гг.), в Петергофе – Английский дворец (1781–1796 гг., полностью разрушен в 1942 г.). В гражданской архитектуре Дж. А. Кваренги одним из первых гармонично приспособил палладианские схемы сельских вилл к плотной городской застройке, вписав дворцовые типы фасадов в единый ряд домов. Использовал объёмные классические колоннады в контрасте с широкими плоскостями стен, прорезанными окнами и отдельными нишами с антикизированной скульптурой. Классический ордер Дж. А. Кваренги мыслил как особую художественную систему, находящуюся «в параллельной жизни» к стенам здания. Его постройки задали центру Санкт-Петербурга монументальный масштаб, в котором работали архитекторы следующего столетия. Среди наиболее значительных санкт-петербургских построек Дж. А. Кваренги – Академия наук (1783–1789 гг.), Ассигнационный банк на Садовой улице (1783–1790 гг.), Екатерининский институт на Фонтанке (1804 г.; ныне часть здания Российской национальной библиотеки), Конногвардейский манеж (1804–1807 гг.), Смольный институт (1806–1808 гг.), Эрмитажный театр (1783–1787 гг.; после окончания строительства театра Дж. А. Кваренги предоставили квартиру в этом здании, где он жил до конца своих дней). В Москве по его проектам были возведены одни из самых крупных зданий, важные в градостроительном отношении: Старый Гостиный двор на Ильинке (1789–1805 гг.; осуществлён Семёном Антоновичем Кариным и Иваном Андреевичем Селеховым, завершён в 1825–1830 гг. при участии Осипа Ивановича Бове, реставрирован в 1994–1999 гг. по проекту Веры Викторовны Путятиной и Инессы Ивановны Казакевич), Шереметевский Странноприимный дом (1803–1807 гг.; при участии Елизвоя Семёновича Назарова в 1792–1803 гг.; ныне НИИ скорой помощи имени Николая Васильевича Склифосовского), Екатерининский (Головинский) дворец в Лефортове (1782–1790 гг., совместно с Франческо Кампорези, ныне Общевойсковая академия Вооружённых Сил РФ). Дж. А. Кваренги принадлежат проекты усадеб (например, Останкино Шереметевых, Ляличи Петра Васильевича Завадовского, Зубриловка Сергея Фёдоровича Голицына), а также храмов и светских зданий провинциальных городов. После принятия императором Павлом I титула протектора (покровителя) Мальтийского ордена, а затем и великого магистра братству Ордена был предоставлен Воронцовский дворец в Санкт-Петербурге. Здесь Дж. А. Кваренги построил католическую и православную церкви (1798–1800 гг.), в которых обратился к раннехристианским образцам.