Ещё до начала военных действий пришло известие о гибели Сихарда. Андрей предложил Контарду жениться на своей дочери Евпраксии, вдове консула Льва. Брак был заключён. Контард организовал заговор, в ходе которого Андрей был убит, а он сам провозглашён консулом (840 г.), но недовольные происшедшими событиями жители Неаполя восстали. Контард с воинами укрылся в епископской резиденции. Горожане захватили здание, убили воинов и обезглавили Контарда и его жену. Консулом был избран Сергий I, во время его правления (840–864 гг.) обстановка в Неаполе оставалась стабильной, политическое значение города возросло. В 842 г. епископ Тиберий скончался и был погребён в базилике святого Ианнуария. Согласно Иоанну Диакону, епископ указал на Иоанна IV Книжника как на единственного достойного преемника. Однако рукоположение Иоанна IV Книжника вызвало недовольство Римского папы Григория IV, который счёл его захватчиком епископской кафедры. Папа прибыл в Неаполь для расследования ситуации, однако, выслушав показания клириков и горожан во главе с консулом Сергием о том, что Иоанн IV Книжник не только не пытался захватить кафедру, но и оказывал знаки почтения епископу Тиберию, он снял обвинения с Иоанна IV Книжника. Иоанн Диакон в продолжении «Деяний Неаполитанских епископов» в общих чертах описывает деятельность Иоанна IV Книжника на епископской кафедре. По инициативе епископа состоялось перенесение останков девяти Неаполитанских епископов из катакомб святого Ианнуария в кафедральный собор Стефания. Иоанн IV Книжник был погребён в оратории святого Лаврентия в катакомбах святого Ианнуария, впоследствии его останки также перенесли в Стефанию, а затем поместили в главном алтаре церкви святой Реституты (сохранились в составе комплекса кафедрального собора). Освидетельствование мощей Иоанна IV Книжника и святой Реституты состоялось 13 мая 1862 г. Часть мощей святого хранится также в капелле Санта-Мария дель Принчипио. 730–740 гг. датируется первая часть «Деяний Неаполитанских епископов» (до 762 г.). По мнению ряда исследователей (например, Д. Маллардо), это произведение написал Иоанн IV Книжник, хотя Иоанн Диакон не упоминает об этом. Иоанну IV Книжнику приписывают участие в создании неаполитанского Мраморного календаря. Однако исследователи считают более вероятным, что календарь был составлен по указанию преемника Иоанна IV Книжника Неаполитанского епископа Афанасия.