По мнению исследователей, если рассмотреть ряд крупнейших позднеантичных учёных-неоплатоников от Прокла и его ученика Аммония к Олимпиодору, Дамаскию, Симпликию и завершить его Евтокием Аскалонским, который, как полагают исследователи, в первой половине VI в. был главой неоплатонической школы Александрии, то окажется, что биография последнего напрямую связана с биографией Исидора из Милета и Анфимия из Тралл. Комментарии к трактату Аполлония Пергского о конических сечениях Евтокий посвятил «любезному другу» Анфимию. Одновременно до нас дошли комментарии Евтокия к трактатам Архимеда, в которых указывается редакция Исидора из Милета, «великого учителя нашего». На основании этого упоминания вплоть до недавнего времени считалось, что Исидор из Милета был учителем Евтокия. Однако, судя по упомянутому обращению Евтокия к Анфимию из Тралл, тот мог быть ровесником или младшим товарищем учёного. В свою очередь, Анфимий из Тралл не мог оказаться моложе Исидора из Милета (источники дают исследователям основания предполагать подчинённое положение Исидора из Милета по отношению к Анфимию из Тралл). Более обоснованным исследователи считают мнение, что слова о «великом учителе» Исидоре из Милета на страницах комментариев Евтокия были добавлены позже учеником Исидора из Милета, который был одновременно издателем сочинения Евтокия. Исследователи считают примечательной ещё одну вставку в сочинении Евтокия, где описывается процесс построения параболы при помощи особого инструмента, «изобретённого милетским механиком Исидором, великим учителем нашим, и описанного им в комментарии, который он составил к сочинению Герона Александрийского “О сводах”». Упоминания о «нашем великом учителе» Исидоре из Милета есть и в так называемой Пятнадцатой книге «Начал» Евклида, по мнению исследователей, лишь условно приписываемой последнему. Указанная книга могла быть составлена тем же или другим учеником Исидора из Милета. Трактат Герона и комментарии к нему не сохранились, как и другие научные труды Исидора из Милета. То, что он был редактором Евтокия, обобщил труды Архимеда и составил комментарий к сочинению Герона о конструкции сводов, не вызывает у исследователей сомнений. Также у исследователей есть все основания полагать, что Исидор из Милета начал научную и преподавательскую деятельность в Александрии и затем стал основателем математической школы в Константинополе. С архитектурно-практической точки зрения учеником Исидора из Милета исследователи предположительно считают его племянника Исидора Младшего, которому были поручены работы по восстановлению купола собора Святой Софии Константинопольской после его обрушения в 558 г. во время ряда землетрясений. Исидор из Милета, по мнению Василия Павловича Зубова, – строитель, учёный «героновского» типа, ориентированный на практику, изобретатель приёмов и инструментов. Наряду с Анфимием из Тралла исследователи считают Исидора из Милета примером особого явления архитектора-учёного в ранней Византии, демонстрирующего выдающийся уровень образования и владения научными знаниями своего времени, а также высокий статус профессии архитектора, чьё искусство прославляется современниками как подвиг человеческого разума, совершаемый во славу Божию.