Решением архиерейского Собора Сербской православной церкви от 19 марта 1946 г. приходы Словакии, в том числе и храм бывшей ладомировской обители, были переданы в состав Чешской епархии РПЦ. Окончательно община при ладомировской Михаило-Архангельской церкви прекратила существование в 1946 г. с уходом архимандрита Саввы (Струве) за штат. К 2010 г. бывший монастырский храм архангела Михаила действует как приходской в составе Прешовской епархии Чешских земель и Словакии Православной Церкви. В Братиславе один из русских эмигрантов предоставил эвакуированным инокам здание на берегу Дуная, в котором была устроена домовая церковь во имя Иова Почаевского и кельи. 20 августа 1944 г. монастырский храм освятил архиепископ Пантелеимон (Рудык). Переселение монахов в Братиславу возглавлял благочинный и эконом иеромонах Иов (Леонтьев). 24 октября 1944 г. архиерейский Синод РПЦЗ постановил возвести иеромонаха Иова в сан игумена за успешную эвакуацию братского имущества, в том числе десяти томов богослужебных книг, а его помощника иеромонаха Киприана (Пыжова) наградить наперсным крестом за основание в Братиславе храма обители. Настоятелем братиславского подворья стал игумен Каллист, эвакуированный из Киева и ранее принадлежавший к так называемой Автономной УПЦ. Там же проживал иеросхимонах Савва (Четвериков). В Германии несколько насельников, архимандрит Серафим (Иванов), игумен Иов (Леонтьев), иеромонах Антоний (Медведев) и послушник Пётр Михайлович Чернобыль (впоследствии монах Нектарий), окормляли части Вооруженных Сил Комитета освобождения народов России. В мае 1945 г., после капитуляции Германии и прихода в Баварию американских войск, 17 насельников под руководством архимандрита Серафима (Иванова) переехали из Германии в город Женеву (Швейцария). В конце 1946 – начале 1947 гг. эта группа насельников эмигрировала из Швейцарии в США, где составила большую часть братии Джорданвиллского монастыря. Помимо архимандрита Серафима в неё вошли также архимандрит Агапит (Крыжановский), игумены Валентин (Богданов), Филимон (Никитин), Никон (Рклицкий), иеромонах Антоний (Медведев), Антоний (Ямщиков), Киприан (Пыжов) и др. Они вывезли в США святыни обители, оборудование монастырской типографии. К конце 1945 г. бывший насельник ладомировского монастыря игумен Иов (Леонтьев), не получивший разрешение на переезд в США из-за болезни, организовал монашескую общину при здании Синода РПЦЗ в районе Богенхаузен (Мюнхен). В неё, кроме игумена, вошли духовник братии иеромонах Никодим (Нагаев; впоследствии епископ Ричмондский РПЦЗ) и четыре послушника. Мюнхенская обитель приняла устав ладомировского монастыря. В начале 1946 г. для мюнхенских иноков было приобретено новое помещение бывшей школы (1939 г.), в котором 28 августа 1946 г. освящена церковь во имя Иова Почаевского. Иконостас в древнерусском стиле расписал в 1944–1946 гг. иеромонах Киприан (Пыжов). 4 марта 1946 г. Синод официально утвердил два европейских подворья Иовского братства – временное в Женеве и постоянное в Мюнхене. Оба подворья непосредственно подчинялись Синоду на правах ставропигии. Мюнхенскую обитель возглавляли в 1946–1959 гг. архимандрит Иов (Леонтьев), в 1959–1966 гг. – архимандрит Корнилий (Малюшицкий), в 1966–1980 гг. – епископ Нафанаил (Львов), пребывавший на покое.