Некоторые из проектов Иоасафа были осуществлены в XIX в. Благодаря его самоотверженным трудам христианство значительно укрепилось в среде ительменов. Память об Иоасафе на Камчатке сохраняется, в частности, в русских фамилиях крещёных, которые давались по фамилиям членов его миссии. 10 декабря 1749 г. на Камчатку прибыл нарочный с высочайшим указом от 5 апреля 1748 г. о наречении Иоасафа епископом Иркутским на вдовствовавшую с 1747 г. кафедру. Он передал миссию иеромонаху Пахомию (указом Синода от 22 июня 1758 г. миссия была закрыта) и выехал с Камчатки. В июне 1750 г. пребывал в Охотске, а с начала сентября по 22 ноября того же года – в Иркутске, где занимался неотложными делами епархиального управления. Перед отъездом в Санкт-Петербург для хиротонии Иоасаф велел сделать копии с рукописей трёх своих сочинений – «Рассуждения нравоучительные на Аввакума пророка», «Семя учения Слова Божия» и «Сок семени учения Слова Божия», которые планировал издать с разрешения Синода (к середине XIX в. все тексты были утрачены). Последнее сочинение было переписано во многих экземплярах и разослано по всем монастырям, церквам и даже острожкам епархии для чтения пастве после литургии. Прибыв в Санкт-Петербург 25 января 1751 г., Иоасаф просил об увольнении его на покой, сославшись на слабое здоровье. Синод удовлетворил его просьбу и 18 февраля 1754 г. уволил от управления епархией и назначил ректором и преподавателем богословия Славяно-латинской академии в Москве, настоятелем Заиконоспасского монастыря. В сентябре 1755 г. Иоасаф был освобождён от преподавания «за немаловременные труды на Камчатке» и оставлен только в должности ректора. 12 мая 1757 г. перемещён на место настоятеля Высокопетровского во имя святителя Петра, митрополита Московского, монастыря. 17 апреля 1758 г. Иоасаф был назначен епископом Кексгольмским и Ладожским, викарием Новгородской епархии. 24 мая того же года состоялась хиротония. В конце мая Иоасаф вступил в управление Юрьевым новгородским монастырём. Служил в сане архиерея лишь один год, умер 29 апреля 1759 г. Иеромонах Амвросий (Орнатский; впоследствии епископ Пензенский) и вслед за ним ряд других авторов приводят другую дату кончины Иоасафа – 6 июня 1758 г., но профессор Иларион Алексеевич Чистович отрицает её достоверность. Иоасаф был погребён на паперти Георгиевского собора Юрьева монастыря на правой стороне.