20 апреля председатель ОЗАКОМ Михаил Иванович Пападжанов сообщал обер-прокурору Синода: «Участившиеся в последнее время недоразумения между грузинами и русскими по церковным делам настоятельно требуют немедленного разрешения вопросов по управлению Церковью и по распределению церквей и монастырей между грузинами и русскими. Ввиду устранения нежелательных осложнений и ожидаемых эксцессов, прошу возможно скоро утвердить положение по управлению Церковью и распределению церквей и монастырей между этими народностями» (Центральный государственный исторический архив Грузии). 26 мая 1918 г. меньшевистское правительство Грузии объявило о государственной независимости страны. Правительство признало необходимым проведение радикальных мер как во внутренней, так и во внешней политике. Отсутствие идейной и материальной поддержки России, а также раздирающая страну политическая анархия и гражданская война привели к тому, что русская паства в Грузии оказалась фактически незащищённой в чужой стране. Духовенство Кавказского экзархата считалось поддерживающим белогвардейское движение и проводящим в Грузии пророссийскую политику. Центральным местом собраний русской паствы и духовенства стал русский собор во имя Александра Невского в Тифлисе, что послужило поводом военному министру Грузии Григол Гиоргадзе запретить служение русскому духовенству. Храм был передан грузинскому духовенству, употребление церковнославянского языка за богослужением запрещено (Центральный государственный исторический архив Грузии). Численность русского духовенства и паствы значительно сократилась, многие приходы были упразднены, церковное имущество действующих церквей и монастырей было расхищено, участились случаи разбойничьих нападений на церкви и духовенство (Центральный государственный исторический архив Грузии). Серьёзной причиной национального противостояния явилась также и тяжба по вопросам церковного имущества. 17 февраля 1920 г. на заседании правительства Грузинской республики был заслушан и принят к рассмотрению вопрос об упразднении Кавказской синодальной конторы. Опираясь на церковные каноны, по которым существование на одной территории двух православных церквей не допускалось, а также на основании принятого 2 августа 1918 г. Национальным Советом республики закона о ликвидации российских учреждений на территории Грузии Кавказский экзархат был упразднён. Постановление вступило в силу 21 февраля 1920 г. (Центральный государственный исторический архив Грузии). 17 марта 1920 г. на заседании правительства был заслушан доклад министра юстиции Раждена Матвеевича Арсенидзе об удовлетворении духовных потребностей негрузинской православной паствы. На основании пункта «в» ст. 7 Конституции Республики Грузии находящиеся на территории республики русские, греческие, осетинские и другие приходы были переведены в юрисдикцию ГПЦ (Центральный государственный исторический архив Грузии).