Историческое сочинение Дуки сохранилось в единственной рукописи XV–XVI вв., первый и последний листы которой утеряны, так что авторское название его труда неизвестно (в научной литературе используется условное название «История»). Сочинение Дука писал в 1450 гг. и закончил около 1462 г. Повествование начинается с краткого обозрения всемирной истории – от Адама до императоров династии Палеологов. Со смерти императора Андроника III Палеолога в 1341 г. Дука подробно излагает византийскую историю. В описании гражданской войны 1341–1347 гг. придерживается позиции сторонников Иоанна VI Кантакузина. С симпатией Дука относится к вопросу об унии с Римско-католической церковью, в которой видит возможность спасти Византию от надвигавшейся турецкой угрозы. Причины униатских настроений Дуки долгое время были предметом споров среди исследователей. Между русскими учёными П.Д. Погодиным и Е.А. Черноусовым в XIX – начале XX в. возникла оживлённая дискуссия по этому поводу. П.Д. Погодин предполагал, что Дука негативно относился к Византии вообще и искренне симпатизировал Западу. Е.А. Черноусов выводил униатскую позицию Дуки из его патриотизма и стремления спасти Византию с помощью Запада. В XX в. этой точки зрения придерживались Светлана Константиновна Красавина и румынский исследователь В. Греку, осуществивший критическое издание сочинения Дуки. Труд Дуки является одним из наиболее полных грекоязычных свидетельств падения Константинополя в 1453 г., несмотря на то что Дука не был очевидцем описываемых событий. Описание падения города он основывает на свидетельствах участников событий, в том числе и турок (наряду с итальянским Дука владел и турецким языком). В заключение автор поместил «Плач о городе», написанный им в том же жанре, что и плач Никиты Хониата при захвате Константинополя в 1204 г. крестоносцами, и восходящий к плачу пророка Иеремии об Иерусалиме. Дука обильно использует в сочинении цитаты из Священного Писания и античной греческой литературы. «История» написана на современном автору греческом языке, в стиле и грамматике преобладают разговорные и народные элементы.