Базовыми раскопками поселения Хирбет-Кумран в 1951–1958 гг. стали работы доминиканца, главы Французской библейской и археологической школы в Иерусалиме, священника Ролана де Во (1903–1971 гг.) и английского археолога Джералда Ланкестера Хардинга, главы Департамента древностей Иордании (этой стране принадлежал северный берег Мёртвого моря); в работах участвовал Палестинский археологический музей (позже музей имени Джона Рокфеллера, Иерусалим). Полный отчёт о раскопках не опубликован, полевые материалы и находки обрабатывает с конца 1980 гг. Французская библейская школа; по её заданию бельгийский археолог Роберт Донсель и его супруга Паулина Донсель-Вут изучили записи, фотографии и находки Ролана де Во, но не довели дело до конца, констатировав, что часть монет и дневника утрачены, а многие материалы потеряли первоначальный вид. В результате фиксационные материалы Библейской школы (сотни фотографий, листы обмеров, суммарные описания из дневников Ролана де Во) были изданы на французском (1994 г.), немецком (1996 г.) и английском (2003 г.) языках, но отсутствие полного отчёта ограничивает для исследователей возможности интерпретации. С 1960 гг. (до и после Шестидневной войны 1967 г. и перехода западного берега моря под контроль Израиля) западные и израильские учёные продолжили раскопки; среди них были: Джон Марко Аллегро; С. Стеколь (он также вскрыл десять или двенадцать могил на кладбище); Рафик Даджани (Департамент древностей Иордании, 1965–1967 гг.). Йосеф Патрих (1984 г. (с Игаэлем Ядином), 1985, 1991, 1994 гг.) изучил окрестности и пещеры и доказал, что их использовали как склады или укрытия; Амир Дрори и Ицхак Маген (1993–1994 гг.) также исследовали окрестности Кумрана (программа Департамента древностей Израиля «Операция “Свитки”»). В 1995–1996 гг. М. Броши и Ханан Эшель продолжили раскопки в пещерах Кумрана и на кладбище; в 1996 г. раскопки вела группа Дж. Стрейнджа; тогда же и позднее (1996–1999, 2001–2004 гг.) – группа под руководством Ицхака Магена и Юваля Пелега. На плато Кумрана с 2002 г. до начала 2010 г. работали Р. Прайс и Орен Гутфельд. До российского читателя материалы исследований в Кумране доходили в переводах популярных книг (Генрих Александр Штоль, Амброджо Донини и др.) и научных обзорах учёных, изучавших рукописи Мёртвого моря и общие вопросы археологии религии. Исследователи отмечают, что с некоторыми поправками (работы Дж. Магнесс, И. Магена, Ю. Пелега и др.) полевые наблюдения Р. де Во сохраняют значение до настоящего времени. Хронология основана на достаточно богатом, хотя не полном и не до конца систематизированном материале. Р. де Во полагал (не все учёные поддерживают его точку зрения), что Кумран возник в VIII в. до н.э. как звено в цепи укреплений на востоке Иудеи, был разорён вавилонянами (VI в. до н.э.) и вновь заселён только в конце II – начале I в. до н.э. при Хасмонеях (при Иоанне I Гиркане, 135/134 – 104 гг. до н.э., или позже, около 100 г. до нэ.), стремившихся к контролю над долиной Иордана и Иудейской пустыней (это подтверждает сходство плана кумранского поселения с планами соседних укреплений Руджм-эль-Бахр (евр. – Мааганит-ха-Мелах), вблизи устья Иордана и Хирбет-Мезин.