После захвата Экбатаны персы заняли Парфию, Гирканию и, как полагают исследователи, Армению – страны, входившие в состав Мидийского царства (согласно Ксенофонту, Гиркания добровольно подчинилась Киру II Великому). Исследователи полагают, что если датировка восстания Кира II Великого на основании вавилонской хроники верна, это должно было произойти около 549 – 548 гг. до н.э. Исследователям неясно, когда Кир II Великий захватил Элам. Вальтер Хинц обращает внимание на клинописный текст, содержащий предсказание о том, что царь Вавилона из «харранской» династии будет свергнут правителем Элама. Царь Вавилона был отождествлён с Набонидом (упоминание о Харране могло указывать на происхождение Набонида и его пристрастие к культу бога луны Сина, почитавшегося в Харране; этот культ Набонид активно насаждал в Вавилонии). Исследователи полагают, что если это отождествление верно, то под правителем Элама должен подразумеваться Кир II Великий, и в этом случае Элам должен был быть покорён персами до завоевания Вавилона. Крупнейшая кампания Кира II Великого до его похода в Месопотамию – война с Лидией. Опасаясь усиления Кира II Великого, лидийский царь Крёз сам начал готовиться к войне, не дожидаясь нападения персов. Он обладал значительным преимуществом, ему были подвластны греческие колонии в Малой Азии и большая часть местного населения. Лидийское царство при Крёзе достигло расцвета, и в трудах греческих историков имя лидийского царя становится нарицательным как символ сказочного богатства. Крёз покровительствовал святилищу Аполлона в Дельфах, и прежде чем начать войну с Киром II Великим, он отправил гонцов к оракулу с вопросом об исходе сражения. На этот вопрос был дан двусмысленный ответ: если Крёз начнёт войну, он сокрушит великое царство, но ему следует взять в помощь сильного союзника среди эллинов. Заручившись поддержкой Спарты, Крёз во главе войска выступил против персов. Согласно Геродоту, война началась с вторжения лидийской армии в Каппадокию – территорию, подконтрольную Мидии и перешедшую под власть Кира II Великого. В 547 г. до н.э. у реки Галис произошла кровопролитная битва; обе стороны понесли большие потери и не решились вступить в повторный бой. Крёз отступил в свою столицу Сарды, чтобы более основательно подготовиться к войне. Кир II Великий лишил Крёза этой возможности, в течение короткого времени собрав у Сард свои войска. Во время сражения Кир II Великий, по свидетельству Геродота, прибег к военной хитрости, выставив перед войском верблюдов: лидийская конница была дезорганизована, ибо лошади бежали, почувствовав незнакомый запах. Лидийские всадники стали сражаться пешими; победа над войском Крёза давалась нелегко, но численный перевес армии Кира II Великого определил исход сражения. Лидийцы укрылись в Сардах, которые Кир II Великий осадил. Через две недели город был захвачен, и Крёз взят в плен. Главный источник информации о войне Кира II Великого с Лидией – сведения, приведённые Геродотом. Из описания Геродота исследователи сделали вывод, что захват Сард произошёл между октябрём и декабрём, однако точного года историк не называет. Согласно вавилонской хронике, в нисане (марте или апреле) девятого года правления Набонида (547 г. до г.э.) Кир II Великий пересёк реку Тигр под Эрбилем. В ияре (апрель или май) вступил в Лидию.