С другой стороны, «Книга Иисуса Навина» демонстрирует смысловое и повествовательное единство с последующими книгами библейского канона, в которых также присутствуют элементы языка и стиля книги «Второзаконие». Согласно теории Мартина Нота, основной текст «Книги Иисуса Навина» не может быть соотнесён с каким-либо источником Пятикнижия, а является составной частью большого исторического труда, включающего книги «Второзакония», «Иисуса Навина», «Судей», «Царств». Он получил название второзаконнической истории, при этом М. Нот отверг наличие в «Книге Иисуса Навина» пласта священнического источника, отмечая лишь его отдельные элементы, которые были ассимилированы в книге в результате второзаконнической редакции всего корпуса книг, входящих в его состав. Большая часть комментаторов следовали теории М. Нота, выделяя при этом разные пласты текста второзаконнической редакции, каждый предлагал свои датировки. Рудольф Сменд выделял во второзаконнической редакции, по меньшей мере, три стадии (или слоя) редактирования. Основная повествовательная часть этого корпуса, включая «Книгу Иисуса Навина», была сформирована в первые годы вавилонского плена; впоследствии этот свод был переработан редактором, связанным с пророческими кругами, и затем редактором, представляющим идеологию религиозного законодательства. Более подробно эта теория была развита В. Дитрихом и Т. Вейолой. Другие исследователи рассматривали второзаконническую историю, связанную с завоеванием Святой земли и отражённую в «Книге Иисуса Навина» как более древний пласт предания, нежели повествования, которые легли в основу всего Пятикнижия. В настоящее время анализ формирования «Книги Иисуса Навина» обычно осуществляется с привлечением обширной литературы всего второзаконнического корпуса. Наиболее подробно текст «Книги Иисуса Навина» с учётом теории многоуровневой второзаконнической редакции рассмотрен в исследовании М. А. О' Брайена. Следы редакторской правки, которая связывает «Книгу Иисуса Навина» с книгой «Второзаконие», просматриваются в повествованиях, говорящих о зависимости военных успехов от научения в законе (Нав. 1:7–8; 23:6). Описания событий в Сихеме (Нав. 8:30–35) развиваются на основании повеления Моисея во Втор. 27. Второзаконническое влияние обнаруживается в истории с блудницей Раав, речь которой построена на основании свойственной богословию книге «Второзакония» аргументации (Нав. 2:1–11). Рассказ о посольстве гаваонитян зависит от предписаний книги «Второзаконие» о различных подходах в войне с близкими и отдалёнными городами (Втор. 20). В «Книге Иисуса Навина» древние предания были пересказаны так, чтобы представить Иисуса Навина в образе идеального правителя, служащего примером для дальнейшей истории Израиля монархического периода.