Первый номер возобновлённого ЖМП вышел 12 сентября 1943 г., в день восшествия митрополита Сергия на патриарший престол. Вплоть до конца 1980 гг. журнал оставался единственным православным периодическим изданием на территории РСФСР и объединял всех, кто писали на церковные темы. С момента возобновления он выходил ежемесячно (за исключением 1994–1996 гг.). Кроме того, было подготовлено шесть специальных выпусков: в 1948 г. (в связи с юбилейными торжествами по поводу 500-летия автокефалии РПЦ и Московским совещанием предстоятелей и представителей поместных православных церквей), 1963 г. (к 50-летию архиерейского служения патриарха Алексия I), 1968 г. (к 50-летию восстановления патриаршества в РПЦ; номер был напечатан в 1971 г.), 1995 г. (к 5-летию патриаршего служения Алексия II), 1997 г. (в связи со 125-летием Среднеазиатской епархии и её посещением предстоятелем РПЦ) и 1999 г. (к 70-летию со дня рождения патриарха Алексия II). Тираж 1940 гг. составлял 15 тыс. экз. и постепенно увеличивался, в 1989 г. достиг 32 тыс. экз.; в последующие годы в связи с экономическими трудностями тираж снизился: в 1995 г. он составил 3 тыс. экз.; далее вновь начал возрастать (в 2008 г. – 9 тыс. экз.). Главными редакторами журнала были патриарх Сергий (1943–1944 гг.), патриарший местоблюститель, впоследствии патриарх Алексий I (1944–1946 гг.), Крутицкий митрополит Николай (Ярушевич; 1946–1960 гг.), Подольский епископ (впоследствии Ярославский архиепископ) Никодим (Ротов; 1960–1961 гг.), архимандрит (впоследствии Волоколамский митрополит) Питирим  (Нечаев; 1962–1994 гг.), Бронницкий епископ (впоследствии архиепископ) Тихон (Емельянов; 1995–2000 гг.), протоиерей Владимир Силовьев (с 2001 г.). Обязанности ответственного секретаря выполняли протоиерей Александр Павлович Смирнов (1943–1949 гг.), Лев Николаевич Парийский (1949–1950 гг.), Алексей Иванович Георгиевский (1950–1953 гг.), Анатолий Васильевич Ведерников (1954–1962 гг.), Евгений Алексеевич Карманов (1963–1981 гг.), Вячеслав Петрович Овсянников (1981–1985 гг.), Константин Михайлович Комаров (1986–1994 гг.), Евгений Семёнович Полищук (1995–1996 гг.), Марина Валентиновна Жилкина (с 1996 г.). В 1943 г. в редколлегию помимо патриарха Сергия входили Ленинградский митрополит Алексий (Симанский), Киевский митрополит Николай (Ярушевич) и Горьковский архиепископ Сергий (Гришин). В 1960 гг. в редколлегии состояли протоиереи Виталий Михайлович Боровой и Всеволод Дмитриевич Шпилер, священник Николай Иванов, Александр Фёдорович Шишкин и др. В 1985–1994 гг. заведующей редакцией была А.Г. Чулюкина. Активное участие в редактировании ЖМП в 1950–1990 гг. принимал ответственный секретарь Отдела внешних церковных связей Алексей Сергеевич Буевский, в 1960–1990 гг. – Павел Васильевич Уржумцев. В годы Великой Отечественной войны публикуемые в ЖМП материалы призывали к самоотверженному труду, утешали скорбящих, воодушевляли защитников страны примерами из истории России, широко освещали патриотическую деятельность РПЦ. В это время выходили статьи митрополита Алексия (Симанского) «Святой благоверный великий князь Александр Невский – покровитель Северного края» и «Христианство и война с гитлеризмом», митрополита Николая (Ярушевича) «Танковая колонна Русской Православной Церкви имени Димитрия Донского», «О русских женщинах-патриотках» и др.