В связи с антицерковной кампанией в период коллективизации количество православных приходов к концу 1929 г. сократилось до 41, а численность духовенства составила 36 человек. Вскоре после издания 29 июля 1927 г. «Декларации» Заместителя Патриаршего Местоблюстителя митрополит Сергия (Страгородского) и Временного при нём Патриаршего Синода на территории Уфимской, затем Златоустовской и Челябинской епархий появилось разделение среди православных на сторонников митрополит Сергия и не признающих митрополита Сергия главой Русской церкви. В результате в 1928 г. образовалась «Уфимско-Уральская (с 1934 г. – Уфимско-Челябинская) автокефальная епархия непоминающих андреевского течения»; по имени идеолога течения архиепископа Андрея (Ухтомского) с кафедрой в Уфе, в состав этой епархии вошла часть приходов Златоустовского викариатства. В документах 1930 гг. Златоустовское викариатство называется как викариатством Свердловской епархии (с 1931 г.), так и самостоятельной епархией. Противоречие исследователи объясняют, в первую очередь, изменением епархиального деления в конце 1920 гг., после издания определения Заместителя Патриаршего Местоблюстителя митрополита Сергия и Временного Патриаршего Синода от 27 декабря 1928 г. об учреждении в патриаршей церкви церковных округов в соответствии с новым гражданским административно-территориальным делением страны на области и округа и о предоставлении особых полномочий архиереям главных городов церковных округов. Территория Уральской области была разделена на два церковных округа – Свердловский и Челябинский (в 1933 г. на территории Уральской области в подчинении митрополита Сергия (Страгородского) было восемь епархий, объединявших 681 приход, и ставропигиальная единоверческая община; в Златоустовской епархии насчитывалось восемь приходов). Златоустовское викариатство, сохраняя статус полусамостоятельной епархии, вошло в Свердловскую церковную область, правящий архиерей которой получил полномочия областного архиерея (в обязанности областного архиерея входили попечение о епархиях его области, оставшихся без епископа, до разрешения вопроса патриархией; выяснение и сообщение патриархии количества, статуса и границ имеющихся в области епархий с указанием входящих в их состав районов, а также количества православных приходов в каждой из них; превращение имеющихся на территории области полусамостоятельных епархий в самостоятельные). 17 января 1934 г. постановлением ВЦИК Уральская область была разделена на три области: Свердловскую с центром в Свердловске, Челябинскую с центром в Челябинске и Обско-Иртышскую с центром в Тюмени. Определением от 12 марта 1934 г. Заместителя Патриаршего Местоблюстителя митрополита Сергия и Временного Патриаршего Синода полномочия областных архиереев были расширены.