На этих заседаниях формулировались решения, которые выносились на обсуждение всех участников Собора. Первое соборное заседание началось с оглашения приветственной благословенной грамоты патриарха Тихона. Делегатов поприветствовал новый министр исповеданий гетманского правительства Александр Лотоцкий, вновь поднявший вопрос о независимости Украинской церкви, что встретило сопротивление большей части участников Собора. 31 октября при наличии 190 делегатов был избран президиум Собора: архиепископ Евлогий (Георгиевский), епископ Пимен (Пегов), профессор Бречкевич, Рогальский, М.А. Кальнев, Исай. В его секретариат вошли: профессор протоиерей Н. Гроссу, протоиерей Феофил Булдовский, Стемпковский. Архиепископа Агапита (Вишневского) и Л. Марченко ввели в состав Соборной рады. Епископ Пимен (Пегов) возглавил хозяйственную комиссию. Были созданы миссионерская – митрополит Антоний, епископ Прокопий (Титов), М. Кальнев); издательская (епископ Никодим (Кротков); монастырская (архимандрит Вениамин (Федченков) комиссии. На третьей сессии одной из центральных тем стало Положение о Высшем церковном управлении на Украине. В «Урядовой комиссии» рассмотрели постановление Всероссийского Собора и послание патриарха Тихона по этому поводу. Комиссия в лице архиепископа Евлогия и протоиерея Ф. Титова 4 ноября представила на утверждение Собора следующие предложения: 1) присовокупить к Положению о Высшем церковном управлении на Украине грамоту патриарха в качестве акта, определяющего автономию Украинской церкви; 2) согласованные с правительством пункты Положения внедрить в жизнь, проинформировав об этом власти Украины; 3) подать на утверждение правительства полные штаты органов Высшего церковного управления; 4) обсудить с правительством ещё не утверждённые им пункты Положения. В комиссию для составления соборного ответа патриарху Тихону вошли: архиепископ Евлогий (Георгиевский), Минский и Туровский архиепископ Георгий (Ярошевский), архимандрит Тихон (Лященко), профессора протоиерей Ф. Титов, протоиерей Н. Гроссу, Ясинский и Каменев. Выступивший на Соборе 5 ноября митрополит Антоний поставил вопрос об автокефалии и проблему католического прозелитизма в западных областях Украины, в резких тонах отозвался о речи министра исповеданий А. Лотоцкого на Соборе. Делегаты потребовали от министра объяснений в связи с нежеланием правительства признать ряд пунктов Положения о Высшем церковном управлении на Украине. Прибыв на Собор 12 ноября, А. Лотоцкий от имени правительства вновь говорил об автокефалии (по имеющимся сведениям, гетман П.П. Скоропадский был против автокефалии и не подписал соответствующую резолюцию правительства), угрожал церкви прекращением государственного финансирования и высылкой в большевистскую Россию недовольных действиями украинских властей. По некоторым данным, в случае отказа объявить автокефалию правительство намеревалось распустить Собор и провести новые выборы делегатов, с тем чтобы обеспечить преобладание сторонников независимости Украинской церкви. 14 ноября произошла смена кабинета министров, новый состав занял более умеренную позицию в церковной политике, что успокоило участников Собора.