На седьмом заседании 5 июля члены, вошедшие в состав ВПЦР после 8 декабря 1917 г. (иеромонах Иоанникий, иеродиакон Порфирий, священники Витвицкий и Словачевский, генералы Новицкий, Радзимовский), были исключены из делегатов Собора. На восьмом заседании 6 июля выступил гетман П.П. Скоропадский, приехавший на Собор в сопровождении В.В. Зеньковского, премьер-министра Ф. Лизогуба, министра просвещения Н. Василенко, гофмаршала М. Ханенко и начальника штаба генерала В. Дашкевича-Горбацкого. Гетману пропели «Спаси, Господи, люди Твоя» с прибавлением: «Победы благоверному гетману Павлу на сопротивныя даруя». С ответным словом на украинском языке выступил митрополит Платон (Рождественский). Делегатам, сторонникам ВПЦР, настаивавшим на том, чтобы их представителю священнику И. Ботвиновскому разрешили обратиться к П.П. Скоропадскому с речью, в которой он намеревался призвать к утверждению автокефалии Украинской церкви, Собор отказал. На заседании была образована следственная комиссия по делу об убийстве митрополита Владимира в составе епископа Прокопия (Титова), архимандрита Тихона (Лященко), священников Г. Лобова и Н. Гаврилова, профессора И. Бич-Лубенского. Финансировать её работу поручили Киево-Печерской лавре. Комиссия работала параллельно с комиссией, образованной Всероссийским Церковным Собором. Активизация делегатов от ВПЦР заставила на восьмом и девятом (7 июля) заседаниях вновь поставить вопрос об их полномочиях. Мандатная комиссия указала на отсутствие необходимых для участия в Соборе документов (ВПЦР первоначально предоставила список из 58 имён, затем сократила его до 46 – по состоянию на 8 декабря 1917 г.). Большинством голосов (172 против 142 при 13 воздержавшихся) за ВПЦР сохранили три мандата с правом самостоятельно определить персональный состав своей делегации. На десятом заседании Собор принял к сведению заявление священника А. Марычева о неприемлемости для ВПЦР соборной резолюции от 7 июля, после чего членам ВПЦР предложили покинуть зал заседаний. Собор потребовал от них письменных объяснений по поводу действий, противных канонам (после окончания работы Собора потерпевшие фиаско делегаты, сторонники автокефалии, опубликовали обращение к украинскому народу, в котором обвинили соборное большинство в москвофильстве и предательстве национальных интересов Украины). На десятом (8 июля) заседании был представлен проект Положения о Высшем церковном управлении на Украине, утверждённый 3 июля комиссией во главе с архиепископом Евлогием, сменившим на этом посту митрополита Антония после его избрания на Киевскую кафедру. Проект предусматривал автономию православной церкви на Украине с сохранением её канонической связи с Московским патриархатом. Патриарх сохранял право утверждать самостоятельно избираемых Киевского митрополита и других украинских архиереев, принимать и рассматривать жалобы на них. Его имя должно было возноситься за богослужением во всех православных храмах Украины. Патриарх являлся для Украинской церкви высшей судебной инстанцией, получал право благословлять созыв Всеукраинского Собора, а после принятия на Соборе Положения о Высшем церковном управлении на Украине утверждал его, после чего документ должна была одобрить высшая государственная власть.