В сентябре 1945 г. епископ Тимофей (Шреттер) обратился в Департамент исповеданий при правительстве Польши с просьбой сохранить православные приходы в Люблине, Хелме, Хрубешуве, Бяла-Подляске, Влодаве и Тересполе, а также Яблочинский Онуфриевский мужской монастырь в селе Яблочино (ныне Яблечна Бяльского повята) «для успокоения религиозных нужд поляков православного вероисповедания». 29 декабря 1945 г. директор департамента исповеданий Я. Демьянчук одобрил просьбу. К июлю 1946 г. в Люблинской епархии было три благочиннических округа. Властями были утверждены благочинные: Люблинского округа – протоиерей Алексий Баранов, Влодавско-Коденского округа – протоиерей Алексий Ушаков, Бяла-Подлясского округа – протоиерей Александр Биронт. 15 июля 1946 г. Собор епископов Польской православной церкви принял решение об упразднении епископских кафедр в Люблине и Кракове. Люблинский епископ Тимофей (Шреттер) был переведён на новообразованную Белостокскую и Бельскую епархию, а бывший митрополит Холмский Иларион (Огиенко) и архиепископ Краковско-Лемковский Палладий (Видыбида-Руденко), эмигрировавшие на Запад, были признаны утратившими свои кафедры и исключёнными из состава Польской православной церкви. В 1946–1947 гг. польские власти провели новую кампанию по закрытию православных храмов на Холмщине и в Подляшье, были арестованы наиболее активные клирики, обвинённые в сотрудничестве с Организацией украинских националистов (ОУН) или в коллаборационизме. Был заключён в концлагерь Явожно священник Василий Ляшенко, судимый по делу бежавшего Николая Шероцкого, благочинного Хрубешувского округа, которого обвинили в том, что он в 1940 г. при поддержке немцев отнял у римо-католиков и преобразовал в православный храм Николаевский собор в Хрубешуве (храм изначально являлся православным, был захвачен римо-католиками в 1920 гг.). В 1945 г. собор был снова передан римо-католикам. В 1946 г. псаломщик православного Космо-Дамиановского прихода в селе Колеховице Даниил Дзядко был приговорён к смертной казни, позже помилован. 29 марта 1947 г. польские власти начали операцию «Висла», целью которой было выселение украинцев из юго-западных воеводств Польши на «возвращенные земли» (до 1945 г. принадлежали Германии). Из Люблинского воеводства были выселены около 34 тыс. православных украинцев. В 1948–1949 гг. в Явожно находились священники Алексий Нестерович (Хелм), Иосиф Кундеус, Александр Мамчур, Николай Костишин, Дамиан Товстюк, диакон Иосиф Бобрович. В 1947–1948 гг. в Явожно отбывали наказание по политическим обвинениям 803 украинца из Люблинского воеводства. 20 мая 1947 г. все недействующие православные храмы Холмщины были переданы в ведение священника Владимира Вежанского, заместителя благочинного Люблинского округа. Однако его функции сводились к руководству эвакуацией церковного имущества, которая полностью завершилась в октябре 1947 г.