Полемист (также как и братчики) видел причины упадка церковной жизни в поступках епископов, писал о необходимости противодействовать униатскому и католическому прозелитизму. Под влиянием трудов Иоанна (Вишенского) один из членов Львовского Успенского братства около 1605 г. написал антиуниатский трактат «Пересторога». Главные причины политического и церковного кризиса в Западной Руси автор видел в недостаточной образованности мирян и в предательской деятельности епископов, которые отступили от православия вследствие тщеславия и алчности. В 1677 г. Львовский епископ Иосиф (Шумлянский) получил королевский привилей о подчинении книгоиздания и финансов братства епископу (привилей стал следствием решений сейма 1676 г. о запрете сношений с восточными патриархами и о подчинении братств власти епископов). Братство обратилось в королевский суд с просьбой отменить это решение, 14 октября 1678 г. выданный Иосифу (Шумлянскому) привилей был отменён (Центральный государственный исторический архив в Ленинграде). В июне 1700 г. братство, узнав об открытом переходе епископа Иосифа (Шумлянского) в унию, провело совещание с другими львовскими организациями мирян, на котором призвало к солидарному противостоянию униатским планам архиерея, но эти призывы не были поддержаны. В 1700–1704 гг. Львовское Успенское братство сопротивлялось попыткам Иосифа (Шумлянского) перевести епархию в унию. В начале 1708 г. из-за полного разорения в результате взятия Львова шведским войском Львовское Успенское братство заявило о готовности присоединиться к унии при условии сохранения за братством ставропигии и прямого подчинения папе Римскому, на что Папский престол дал согласие (как показали дальнейшие события, право ставропигии, неизвестное в Римско-католической церкви, сохранялось за Львовским Успенским братством формально). 2 мая 1708 г. члены братства публично произнесли католическое исповедание веры. После Замойского собора 1720 г. Львовский епископ Афанасий (Шептицкий) пытался подчинить себе братство, сообщив в Варшавскую нунциатуру о том, что братские издания заражены «схизмой». Нунциатура наложила секвестр на типографию, снять который братству удалось в 1728 г. (Центральный государственный исторический архив в Ленинграде). В 1737–1771 гг. братство получало разрешение на издание книг от униатских Львовских епископов. После вхождения Галиции в состав Австро-Венгрии (1772 г.) типографии братства вновь пришлось отстаивать право на существование. В 1783 г. был выдан привилей цесаря Иосифа II Йозефу Риттеру фон Курцбеку на право печатания в Вене кириллических книг. Это означало, что Львовская типография должна была прекратить существование. Братство сумело отстоять свои права, славянская типография в Вене не была организована. Однако все издания братства, включая церковные календари и объявления, с 1785 г. проходили жёсткую цензуру. В 1788 г. австрийское правительство ликвидировало Львовское Успенское братство, преобразовав его в Ставропигийский институт.